RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637671.1

SYNGAP1-223, Transcript of synaptic Ras GTPase activating protein 1, human

TSL 5

Gene SYNGAP1, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYNGAP1-223	ENST00000637671		J3QR89	54 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.82	□□□□□ -1.8
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.8	□□□□□ -1.8
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.79	□□□□□ -1.8
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.77	□□□□□ -1.81
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.77	□□□□□ -1.81
SYNGAP1-223	ENST00000637671	COA5	Q86WW8	74 aa		3.76	□□□□□ -1.81
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.75	□□□□□ -1.81
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.7	□□□□□ -1.82
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A8MU10	97 aa		3.67	□□□□□ -1.82
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.64	□□□□□ -1.83
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A0A1B0GV90	55 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.63	□□□□□ -1.83
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A0A1B0GU69	56 aa		3.61	□□□□□ -1.83
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.56	□□□□□ -1.84
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MT1A	P04731	61 aa		3.51	□□□□□ -1.85
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.5	□□□□□ -1.85
SYNGAP1-223	ENST00000637671	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.48	□□□□□ -1.85
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.46	□□□□□ -1.86
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7ERU9	68 aa		3.45	□□□□□ -1.86
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.44	□□□□□ -1.86
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.43	□□□□□ -1.86
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.42	□□□□□ -1.86
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.4	□□□□□ -1.87
SYNGAP1-223	ENST00000637671		H7BZZ5	65 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYNGAP1-223	ENST00000637671	COX7C	P15954	63 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.27	□□□□□ -1.89
SYNGAP1-223	ENST00000637671	UQCR11	O14957	56 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MT3	P25713	68 aa		3.25	□□□□□ -1.89
SYNGAP1-223	ENST00000637671		K7ERS5	55 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		3.22	□□□□□ -1.89
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.21	□□□□□ -1.9
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SYNGAP1-223	ENST00000637671	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.03	□□□□□ -1.92
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.97	□□□□□ -1.93
SYNGAP1-223	ENST00000637671	CCDC179	H3BU77	68 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.94	□□□□□ -1.94
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.9	□□□□□ -1.95
SYNGAP1-223	ENST00000637671		Q1T7F1	81 aa		2.88	□□□□□ -1.95
SYNGAP1-223	ENST00000637671	ROMO1	P60602	79 aa		2.87	□□□□□ -1.95
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PSPHP1	O15172	72 aa		2.85	□□□□□ -1.95
SYNGAP1-223	ENST00000637671	TMEM258	P61165	79 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.84	□□□□□ -1.95
SYNGAP1-223	ENST00000637671		V9GYY9	64 aa		2.81	□□□□□ -1.96
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A6NED7	52 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.65	□□□□□ -1.99
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.64	□□□□□ -1.99
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.58	□□□□□ -2
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.41	□□□□□ -2.02
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.3	□□□□□ -2.04
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.2	□□□□□ -2.06
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.18	□□□□□ -2.06
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.16	□□□□□ -2.06
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.98	□□□□□ -2.09
SYNGAP1-223	ENST00000637671	BRK1	Q8WUW1	75 aa		1.93	□□□□□ -2.1
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRAC1	Q96KF2	57 aa		1.76	□□□□□ -2.13
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PMAIP1	Q13794	54 aa		1.73	□□□□□ -2.13
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PCP4	P48539	62 aa		1.69	□□□□□ -2.14
SYNGAP1-223	ENST00000637671	LUZP6	Q538Z0	58 aa		1.64	□□□□□ -2.15
SYNGAP1-223	ENST00000637671	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.53	□□□□□ -2.16
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRM1	P04553	51 aa		1.43	□□□□□ -2.18
SYNGAP1-223	ENST00000637671	SVIP	Q8NHG7	77 aa		1.33	□□□□□ -2.2
SYNGAP1-223	ENST00000637671	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		1.25	□□□□□ -2.21
SYNGAP1-223	ENST00000637671	PRO0628	Q9UI54	55 aa		1.18	□□□□□ -2.22
SYNGAP1-223	ENST00000637671	NDUFAF8	A1L188	74 aa		0.78	□□□□□ -2.28
SYNGAP1-223	ENST00000637671	INE1	O15225	51 aa		0.54	□□□□□ -2.32
SYNGAP1-223	ENST00000637671		A0A0A0MQY5	61 aa		0.35	□□□□□ -2.35
SYNGAP1-223	ENST00000637671		H3BS24	57 aa		-0.14	□□□□□ -2.43

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