RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636934.1

CLN8-211, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CLN8, Length 1,790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-211ENST00000636934 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
CLN8-211ENST00000636934 MT1EP04732 61 aa6.56□□□□□ -1.36
CLN8-211ENST00000636934 MT1LQ93083 61 aa6.5□□□□□ -1.37
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.46□□□□□ -1.38
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.34□□□□□ -1.4
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.34□□□□□ -1.4
CLN8-211ENST00000636934 NEBP20929 6669 aa6.32□□□□□ -1.4
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.31□□□□□ -1.4
CLN8-211ENST00000636934 INE1O15225 51 aa6.26□□□□□ -1.41
CLN8-211ENST00000636934 MT1GP13640 62 aa6.21□□□□□ -1.41
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.21□□□□□ -1.41
CLN8-211ENST00000636934 MT1MQ8N339 61 aa6.14□□□□□ -1.43
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.13□□□□□ -1.43
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.13□□□□□ -1.43
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.13□□□□□ -1.43
CLN8-211ENST00000636934 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.13□□□□□ -1.43
CLN8-211ENST00000636934 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.08□□□□□ -1.44
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.02□□□□□ -1.45
CLN8-211ENST00000636934 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.01□□□□□ -1.45
CLN8-211ENST00000636934 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.93□□□□□ -1.46
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-9P26371 169 aa5.87□□□□□ -1.47
CLN8-211ENST00000636934 MDN1Q9NU22 5596 aa5.85□□□□□ -1.47
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.74□□□□□ -1.49
CLN8-211ENST00000636934 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.72□□□□□ -1.49
CLN8-211ENST00000636934 SPRR2EP22531 72 aa5.65□□□□□ -1.5
CLN8-211ENST00000636934 SPRR2BP35325 72 aa5.65□□□□□ -1.5
CLN8-211ENST00000636934 SPRR2AP35326 72 aa5.65□□□□□ -1.5
CLN8-211ENST00000636934 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.59□□□□□ -1.51
CLN8-211ENST00000636934 MT1AP04731 61 aa5.53□□□□□ -1.52
CLN8-211ENST00000636934 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
CLN8-211ENST00000636934 SPRR2DP22532 72 aa5.48□□□□□ -1.53
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.47□□□□□ -1.53
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
CLN8-211ENST00000636934 LCE3BQ5TA77 95 aa5.45□□□□□ -1.54
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP12-4P60329 112 aa5.32□□□□□ -1.56
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.21□□□□□ -1.57
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.19□□□□□ -1.58
CLN8-211ENST00000636934 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
CLN8-211ENST00000636934 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.16□□□□□ -1.58
CLN8-211ENST00000636934 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.08□□□□□ -1.6
CLN8-211ENST00000636934 MT3P25713 68 aa5.01□□□□□ -1.61
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.99□□□□□ -1.61
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.96□□□□□ -1.62
CLN8-211ENST00000636934 LCE1DQ5T752 114 aa4.96□□□□□ -1.62
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.93□□□□□ -1.62
CLN8-211ENST00000636934 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.93□□□□□ -1.62
CLN8-211ENST00000636934 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.9□□□□□ -1.62
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.84□□□□□ -1.63
CLN8-211ENST00000636934 MT4P47944 62 aa4.83□□□□□ -1.64
CLN8-211ENST00000636934 LCE4AQ5TA78 99 aa4.82□□□□□ -1.64
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.68□□□□□ -1.66
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.67□□□□□ -1.66
CLN8-211ENST00000636934 PRM1P04553 51 aa4.65□□□□□ -1.66
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.65□□□□□ -1.66
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.61□□□□□ -1.67
CLN8-211ENST00000636934 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.46□□□□□ -1.69
CLN8-211ENST00000636934 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
CLN8-211ENST00000636934 LCE1EQ5T753 118 aa4.21□□□□□ -1.74
CLN8-211ENST00000636934 MUC5ACP98088 5654 aa4.2□□□□□ -1.74
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.14□□□□□ -1.75
CLN8-211ENST00000636934 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-8O75690 187 aa4.05□□□□□ -1.76
CLN8-211ENST00000636934 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.97□□□□□ -1.77
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.97□□□□□ -1.77
CLN8-211ENST00000636934 LCE1CQ5T751 118 aa3.92□□□□□ -1.78
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.9□□□□□ -1.79
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.88□□□□□ -1.79
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.77□□□□□ -1.81
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.81
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.56□□□□□ -1.84
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.41□□□□□ -1.86
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.13□□□□□ -1.91
CLN8-211ENST00000636934 LCE1FQ5T754 118 aa2.97□□□□□ -1.93
CLN8-211ENST00000636934 PHGR1C9JFL3 82 aa2.93□□□□□ -1.94
CLN8-211ENST00000636934 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.93□□□□□ -1.94
CLN8-211ENST00000636934 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.69□□□□□ -1.98
CLN8-211ENST00000636934 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.96□□□□□ -2.1
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