RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613271.4

VWCE-208, Transcript of von Willebrand factor C and EGF domains, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene VWCE, Length 3,032 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4□□□□□ -1.77
VWCE-208ENST00000613271 MT1LQ93083 61 aa4□□□□□ -1.77
VWCE-208ENST00000613271 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
VWCE-208ENST00000613271 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.95□□□□□ -1.78
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP12-4P60329 112 aa3.94□□□□□ -1.78
VWCE-208ENST00000613271 MT1EP04732 61 aa3.94□□□□□ -1.78
VWCE-208ENST00000613271 MT1GP13640 62 aa3.92□□□□□ -1.78
VWCE-208ENST00000613271 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.91□□□□□ -1.78
VWCE-208ENST00000613271 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
VWCE-208ENST00000613271 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
VWCE-208ENST00000613271 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.81□□□□□ -1.8
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.81□□□□□ -1.8
VWCE-208ENST00000613271 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.77□□□□□ -1.81
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.76□□□□□ -1.81
VWCE-208ENST00000613271 LCE3BQ5TA77 95 aa3.73□□□□□ -1.81
VWCE-208ENST00000613271 MT1MQ8N339 61 aa3.67□□□□□ -1.82
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.6□□□□□ -1.83
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.6□□□□□ -1.83
VWCE-208ENST00000613271 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.57□□□□□ -1.84
VWCE-208ENST00000613271 MDN1Q9NU22 5596 aa3.57□□□□□ -1.84
VWCE-208ENST00000613271 PRM1P04553 51 aa3.54□□□□□ -1.84
VWCE-208ENST00000613271 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.49□□□□□ -1.85
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.48□□□□□ -1.85
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
VWCE-208ENST00000613271 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.44□□□□□ -1.86
VWCE-208ENST00000613271 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.42□□□□□ -1.86
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.39□□□□□ -1.87
VWCE-208ENST00000613271 MT1AP04731 61 aa3.38□□□□□ -1.87
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.34□□□□□ -1.87
VWCE-208ENST00000613271 NEBP20929 6669 aa3.3□□□□□ -1.88
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.3□□□□□ -1.88
VWCE-208ENST00000613271 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.3□□□□□ -1.88
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-9P26371 169 aa3.28□□□□□ -1.88
VWCE-208ENST00000613271 SPRR2EP22531 72 aa3.27□□□□□ -1.89
VWCE-208ENST00000613271 SPRR2BP35325 72 aa3.27□□□□□ -1.89
VWCE-208ENST00000613271 SPRR2AP35326 72 aa3.27□□□□□ -1.89
VWCE-208ENST00000613271 LCE1EQ5T753 118 aa3.22□□□□□ -1.89
VWCE-208ENST00000613271 SPRR2DP22532 72 aa3.14□□□□□ -1.91
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.11□□□□□ -1.91
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.08□□□□□ -1.92
VWCE-208ENST00000613271 LCE1DQ5T752 114 aa3.06□□□□□ -1.92
VWCE-208ENST00000613271 LCE1FQ5T754 118 aa2.96□□□□□ -1.94
VWCE-208ENST00000613271 MT3P25713 68 aa2.94□□□□□ -1.94
VWCE-208ENST00000613271 MT4P47944 62 aa2.87□□□□□ -1.95
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.82□□□□□ -1.96
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.8□□□□□ -1.96
VWCE-208ENST00000613271 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.79□□□□□ -1.96
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.71□□□□□ -1.97
VWCE-208ENST00000613271 MUC5ACP98088 5654 aa2.7□□□□□ -1.98
VWCE-208ENST00000613271 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.67□□□□□ -1.98
VWCE-208ENST00000613271 LCE4AQ5TA78 99 aa2.67□□□□□ -1.98
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.62□□□□□ -1.99
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.62□□□□□ -1.99
VWCE-208ENST00000613271 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.61□□□□□ -1.99
VWCE-208ENST00000613271 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.56□□□□□ -2
VWCE-208ENST00000613271 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.52□□□□□ -2.01
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.52□□□□□ -2.01
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.46□□□□□ -2.02
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.41□□□□□ -2.02
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.28□□□□□ -2.04
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.25□□□□□ -2.05
VWCE-208ENST00000613271 LCE1CQ5T751 118 aa2.22□□□□□ -2.05
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.21□□□□□ -2.06
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-8O75690 187 aa2.19□□□□□ -2.06
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.18□□□□□ -2.06
VWCE-208ENST00000613271 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.16□□□□□ -2.06
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.12□□□□□ -2.07
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.11□□□□□ -2.07
VWCE-208ENST00000613271 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.01□□□□□ -2.09
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2□□□□□ -2.09
VWCE-208ENST00000613271 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.93□□□□□ -2.1
VWCE-208ENST00000613271 PHGR1C9JFL3 82 aa1.66□□□□□ -2.14
VWCE-208ENST00000613271 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 97.5 ms