RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612048.4

P3H3-211, Transcript of prolyl 3-hydroxylase 3, human

TSL 1 (best)

Gene P3H3, Length 2,129 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.89	□□□□□ -1.47
P3H3-211	ENST00000612048	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.88	□□□□□ -1.47
P3H3-211	ENST00000612048	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.82	□□□□□ -1.48
P3H3-211	ENST00000612048	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.79	□□□□□ -1.48
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.74	□□□□□ -1.49
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.71	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.71	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.71	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.71	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.7	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	MT1G	P13640	62 aa		5.69	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	MT1M	Q8N339	61 aa		5.68	□□□□□ -1.5
P3H3-211	ENST00000612048	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.62	□□□□□ -1.51
P3H3-211	ENST00000612048	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.61	□□□□□ -1.51
P3H3-211	ENST00000612048	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.58	□□□□□ -1.52
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.49	□□□□□ -1.53
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
P3H3-211	ENST00000612048	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
P3H3-211	ENST00000612048	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.43	□□□□□ -1.54
P3H3-211	ENST00000612048	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.42	□□□□□ -1.54
P3H3-211	ENST00000612048	SPRR2E	P22531	72 aa		5.31	□□□□□ -1.56
P3H3-211	ENST00000612048	SPRR2B	P35325	72 aa		5.31	□□□□□ -1.56
P3H3-211	ENST00000612048	SPRR2A	P35326	72 aa		5.31	□□□□□ -1.56
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.27	□□□□□ -1.57
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.23	□□□□□ -1.57
P3H3-211	ENST00000612048	SPRR2D	P22532	72 aa		5.09	□□□□□ -1.59
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.08	□□□□□ -1.6
P3H3-211	ENST00000612048	MT1A	P04731	61 aa		5.05	□□□□□ -1.6
P3H3-211	ENST00000612048	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.02	□□□□□ -1.61
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.01	□□□□□ -1.61
P3H3-211	ENST00000612048	NEB	P20929	6669 aa		4.96	□□□□□ -1.62
P3H3-211	ENST00000612048	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.79	□□□□□ -1.64
P3H3-211	ENST00000612048	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.71	□□□□□ -1.66
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.67	□□□□□ -1.66
P3H3-211	ENST00000612048	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.65	□□□□□ -1.67
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.61	□□□□□ -1.67
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.6	□□□□□ -1.67
P3H3-211	ENST00000612048	MT3	P25713	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.52	□□□□□ -1.69
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.5	□□□□□ -1.69
P3H3-211	ENST00000612048	MT4	P47944	62 aa		4.47	□□□□□ -1.69
P3H3-211	ENST00000612048	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.45	□□□□□ -1.7
P3H3-211	ENST00000612048	PRM1	P04553	51 aa		4.42	□□□□□ -1.7
P3H3-211	ENST00000612048	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.39	□□□□□ -1.71
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.37	□□□□□ -1.71
P3H3-211	ENST00000612048	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.31	□□□□□ -1.72
P3H3-211	ENST00000612048	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.3	□□□□□ -1.72
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.3	□□□□□ -1.72
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.2	□□□□□ -1.74
P3H3-211	ENST00000612048	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.84	□□□□□ -1.79
P3H3-211	ENST00000612048	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.77	□□□□□ -1.81
P3H3-211	ENST00000612048	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.76	□□□□□ -1.81
P3H3-211	ENST00000612048	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.71	□□□□□ -1.82
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.71	□□□□□ -1.82
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.7	□□□□□ -1.82
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.66	□□□□□ -1.82
P3H3-211	ENST00000612048	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.64	□□□□□ -1.83
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.64	□□□□□ -1.83
P3H3-211	ENST00000612048	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.61	□□□□□ -1.83
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.57	□□□□□ -1.84
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.47	□□□□□ -1.85
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.31	□□□□□ -1.88
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.14	□□□□□ -1.91
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.14	□□□□□ -1.91
P3H3-211	ENST00000612048	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3	□□□□□ -1.93
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.99	□□□□□ -1.93
P3H3-211	ENST00000612048	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
P3H3-211	ENST00000612048	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.81	□□□□□ -1.96
P3H3-211	ENST00000612048	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.72	□□□□□ -1.97
P3H3-211	ENST00000612048	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.7	□□□□□ -1.98
P3H3-211	ENST00000612048	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.65	□□□□□ -1.99
P3H3-211	ENST00000612048	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.77	□□□□□ -2.13

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