RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000611958.4

CAP2-208, Transcript of cyclase associated actin cytoskeleton regulatory protein 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CAP2, Length 2,686 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		6.06	□□□□□ -1.44
CAP2-208	ENST00000611958	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.01	□□□□□ -1.45
CAP2-208	ENST00000611958	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.95	□□□□□ -1.46
CAP2-208	ENST00000611958	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.94	□□□□□ -1.46
CAP2-208	ENST00000611958	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.9	□□□□□ -1.47
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.9	□□□□□ -1.47
CAP2-208	ENST00000611958	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.88	□□□□□ -1.47
CAP2-208	ENST00000611958	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CAP2-208	ENST00000611958	MT1M	Q8N339	61 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CAP2-208	ENST00000611958	MT1G	P13640	62 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.81	□□□□□ -1.48
CAP2-208	ENST00000611958	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.75	□□□□□ -1.49
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.65	□□□□□ -1.51
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.65	□□□□□ -1.51
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.65	□□□□□ -1.51
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.57	□□□□□ -1.52
CAP2-208	ENST00000611958	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.57	□□□□□ -1.52
CAP2-208	ENST00000611958	SPRR2E	P22531	72 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAP2-208	ENST00000611958	SPRR2B	P35325	72 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAP2-208	ENST00000611958	SPRR2A	P35326	72 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
CAP2-208	ENST00000611958	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.29	□□□□□ -1.56
CAP2-208	ENST00000611958	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.28	□□□□□ -1.56
CAP2-208	ENST00000611958	SPRR2D	P22532	72 aa		5.26	□□□□□ -1.57
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.2	□□□□□ -1.58
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.17	□□□□□ -1.58
CAP2-208	ENST00000611958	MT1A	P04731	61 aa		5.16	□□□□□ -1.58
CAP2-208	ENST00000611958	NEB	P20929	6669 aa		5.04	□□□□□ -1.6
CAP2-208	ENST00000611958	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5	□□□□□ -1.61
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAP2-208	ENST00000611958	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CAP2-208	ENST00000611958	MT4	P47944	62 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CAP2-208	ENST00000611958	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CAP2-208	ENST00000611958	MT3	P25713	68 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CAP2-208	ENST00000611958	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CAP2-208	ENST00000611958	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CAP2-208	ENST00000611958	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CAP2-208	ENST00000611958	PRM1	P04553	51 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.28	□□□□□ -1.72
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.07	□□□□□ -1.76
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.05	□□□□□ -1.76
CAP2-208	ENST00000611958	MUC5AC	P98088	5654 aa		4	□□□□□ -1.77
CAP2-208	ENST00000611958	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.91	□□□□□ -1.78
CAP2-208	ENST00000611958	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.87	□□□□□ -1.79
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.79	□□□□□ -1.8
CAP2-208	ENST00000611958	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.78	□□□□□ -1.8
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.69	□□□□□ -1.82
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.66	□□□□□ -1.82
CAP2-208	ENST00000611958	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.65	□□□□□ -1.82
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CAP2-208	ENST00000611958	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.45	□□□□□ -1.86
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.4	□□□□□ -1.86
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
CAP2-208	ENST00000611958	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.22	□□□□□ -1.89
CAP2-208	ENST00000611958	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.2	□□□□□ -1.9
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.17	□□□□□ -1.9
CAP2-208	ENST00000611958	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.05	□□□□□ -1.92
CAP2-208	ENST00000611958	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.78	□□□□□ -1.96
CAP2-208	ENST00000611958	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.76	□□□□□ -1.97
CAP2-208	ENST00000611958	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
CAP2-208	ENST00000611958	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.78	□□□□□ -2.12

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