RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000609454.5

ANKRD54-211, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene ANKRD54, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE1DQ5T752 114 aa6.66□□□□□ -1.34
ANKRD54-211ENST00000609454 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.64□□□□□ -1.35
ANKRD54-211ENST00000609454 MT4P47944 62 aa6.63□□□□□ -1.35
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP12-3P60328 96 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD54-211ENST00000609454 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.62□□□□□ -1.35
ANKRD54-211ENST00000609454 K7ERS5 55 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD54-211ENST00000609454 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.52□□□□□ -1.37
ANKRD54-211ENST00000609454 V9GYY9 64 aa6.5□□□□□ -1.37
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.47□□□□□ -1.37
ANKRD54-211ENST00000609454 PSPHP1O15172 72 aa6.46□□□□□ -1.38
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.45□□□□□ -1.38
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.37□□□□□ -1.39
ANKRD54-211ENST00000609454 Q1T7F1 81 aa6.36□□□□□ -1.39
ANKRD54-211ENST00000609454 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.29□□□□□ -1.4
ANKRD54-211ENST00000609454 A6NED7 52 aa6.28□□□□□ -1.4
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.23□□□□□ -1.41
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.22□□□□□ -1.41
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP12-4P60329 112 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD54-211ENST00000609454 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.18□□□□□ -1.42
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.17□□□□□ -1.42
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.15□□□□□ -1.42
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.14□□□□□ -1.43
ANKRD54-211ENST00000609454 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.13□□□□□ -1.43
ANKRD54-211ENST00000609454 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.11□□□□□ -1.43
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.07□□□□□ -1.44
ANKRD54-211ENST00000609454 ROMO1P60602 79 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.04□□□□□ -1.44
ANKRD54-211ENST00000609454 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
ANKRD54-211ENST00000609454 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.94□□□□□ -1.46
ANKRD54-211ENST00000609454 PCP4P48539 62 aa5.81□□□□□ -1.48
ANKRD54-211ENST00000609454 MT1AP04731 61 aa5.8□□□□□ -1.48
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.76□□□□□ -1.49
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.64□□□□□ -1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.63□□□□□ -1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.62□□□□□ -1.51
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-8O75690 187 aa5.39□□□□□ -1.55
ANKRD54-211ENST00000609454 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD54-211ENST00000609454 MT3P25713 68 aa5.36□□□□□ -1.55
ANKRD54-211ENST00000609454 BRK1Q8WUW1 75 aa5.3□□□□□ -1.56
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.23□□□□□ -1.57
ANKRD54-211ENST00000609454 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.2□□□□□ -1.58
ANKRD54-211ENST00000609454 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
ANKRD54-211ENST00000609454 MUC5ACP98088 5654 aa5.16□□□□□ -1.58
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.07□□□□□ -1.6
ANKRD54-211ENST00000609454 PMAIP1Q13794 54 aa4.98□□□□□ -1.61
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE1EQ5T753 118 aa4.87□□□□□ -1.63
ANKRD54-211ENST00000609454 PRAC1Q96KF2 57 aa4.77□□□□□ -1.65
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.69□□□□□ -1.66
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.57□□□□□ -1.68
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE1CQ5T751 118 aa4.52□□□□□ -1.69
ANKRD54-211ENST00000609454 PRO0628Q9UI54 55 aa4.46□□□□□ -1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.41□□□□□ -1.7
ANKRD54-211ENST00000609454 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.31□□□□□ -1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 SVIPQ8NHG7 77 aa4.28□□□□□ -1.72
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.23□□□□□ -1.73
ANKRD54-211ENST00000609454 LUZP6Q538Z0 58 aa4.19□□□□□ -1.74
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.08□□□□□ -1.76
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
ANKRD54-211ENST00000609454 LCE1FQ5T754 118 aa4.01□□□□□ -1.77
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.76□□□□□ -1.81
ANKRD54-211ENST00000609454 PHGR1C9JFL3 82 aa3.66□□□□□ -1.82
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.52□□□□□ -1.85
ANKRD54-211ENST00000609454 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.29□□□□□ -1.88
ANKRD54-211ENST00000609454 NDUFAF8A1L188 74 aa3.16□□□□□ -1.9
ANKRD54-211ENST00000609454 PRM1P04553 51 aa3.08□□□□□ -1.92
ANKRD54-211ENST00000609454 H3BS24 57 aa2.9□□□□□ -1.95
ANKRD54-211ENST00000609454 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.78□□□□□ -1.96
ANKRD54-211ENST00000609454 INE1O15225 51 aa2.51□□□□□ -2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 A0A0A0MQY5 61 aa2.48□□□□□ -2.01
ANKRD54-211ENST00000609454 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.35□□□□□ -2.03
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