RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602028.5

TIMM50-218, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 50, humanhuman

TSL 5

Gene TIMM50, Length 770 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM50-218ENST00000602028 Q1T7F1 81 aa7.67□□□□□ -1.18
TIMM50-218ENST00000602028 MT1LQ93083 61 aa7.63□□□□□ -1.19
TIMM50-218ENST00000602028 PSPHP1O15172 72 aa7.6□□□□□ -1.19
TIMM50-218ENST00000602028 MT1MQ8N339 61 aa7.56□□□□□ -1.2
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.55□□□□□ -1.2
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP12-3P60328 96 aa7.49□□□□□ -1.21
TIMM50-218ENST00000602028 A6NED7 52 aa7.41□□□□□ -1.22
TIMM50-218ENST00000602028 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TIMM50-218ENST00000602028 LCE4AQ5TA78 99 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.31□□□□□ -1.24
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMM50-218ENST00000602028 PCP4P48539 62 aa7.27□□□□□ -1.25
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMM50-218ENST00000602028 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.24□□□□□ -1.25
TIMM50-218ENST00000602028 LCE1DQ5T752 114 aa7.21□□□□□ -1.26
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.17□□□□□ -1.26
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.15□□□□□ -1.26
TIMM50-218ENST00000602028 MT4P47944 62 aa7.13□□□□□ -1.27
TIMM50-218ENST00000602028 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.12□□□□□ -1.27
TIMM50-218ENST00000602028 ROMO1P60602 79 aa7.09□□□□□ -1.27
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.06□□□□□ -1.28
TIMM50-218ENST00000602028 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.06□□□□□ -1.28
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.92□□□□□ -1.3
TIMM50-218ENST00000602028 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.91□□□□□ -1.3
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP12-4P60329 112 aa6.82□□□□□ -1.32
TIMM50-218ENST00000602028 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.8□□□□□ -1.32
TIMM50-218ENST00000602028 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.79□□□□□ -1.32
TIMM50-218ENST00000602028 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.78□□□□□ -1.32
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.74□□□□□ -1.33
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.65□□□□□ -1.34
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.54□□□□□ -1.36
TIMM50-218ENST00000602028 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
TIMM50-218ENST00000602028 MT1AP04731 61 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMM50-218ENST00000602028 BRK1Q8WUW1 75 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.41□□□□□ -1.38
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.41□□□□□ -1.38
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.41□□□□□ -1.38
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.28□□□□□ -1.4
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.15□□□□□ -1.42
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.12□□□□□ -1.43
TIMM50-218ENST00000602028 PMAIP1Q13794 54 aa6.08□□□□□ -1.44
TIMM50-218ENST00000602028 MT3P25713 68 aa6□□□□□ -1.45
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-8O75690 187 aa5.9□□□□□ -1.46
TIMM50-218ENST00000602028 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.85□□□□□ -1.47
TIMM50-218ENST00000602028 PRAC1Q96KF2 57 aa5.73□□□□□ -1.49
TIMM50-218ENST00000602028 PRO0628Q9UI54 55 aa5.7□□□□□ -1.5
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.65□□□□□ -1.5
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.61□□□□□ -1.51
TIMM50-218ENST00000602028 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TIMM50-218ENST00000602028 MUC5ACP98088 5654 aa5.58□□□□□ -1.52
TIMM50-218ENST00000602028 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
TIMM50-218ENST00000602028 LCE1EQ5T753 118 aa5.5□□□□□ -1.53
TIMM50-218ENST00000602028 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.45□□□□□ -1.54
TIMM50-218ENST00000602028 SVIPQ8NHG7 77 aa5.2□□□□□ -1.58
TIMM50-218ENST00000602028 LCE1CQ5T751 118 aa5.09□□□□□ -1.59
TIMM50-218ENST00000602028 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.09□□□□□ -1.59
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.09□□□□□ -1.59
TIMM50-218ENST00000602028 LUZP6Q538Z0 58 aa5.04□□□□□ -1.6
TIMM50-218ENST00000602028 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.03□□□□□ -1.6
TIMM50-218ENST00000602028 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.75□□□□□ -1.65
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.6□□□□□ -1.67
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.51□□□□□ -1.69
TIMM50-218ENST00000602028 LCE1FQ5T754 118 aa4.5□□□□□ -1.69
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.23□□□□□ -1.73
TIMM50-218ENST00000602028 NDUFAF8A1L188 74 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMM50-218ENST00000602028 PHGR1C9JFL3 82 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.78□□□□□ -1.8
TIMM50-218ENST00000602028 PRM1P04553 51 aa3.58□□□□□ -1.84
TIMM50-218ENST00000602028 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.58□□□□□ -1.84
TIMM50-218ENST00000602028 INE1O15225 51 aa3.3□□□□□ -1.88
TIMM50-218ENST00000602028 A0A0A0MQY5 61 aa3.25□□□□□ -1.89
TIMM50-218ENST00000602028 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3□□□□□ -1.93
TIMM50-218ENST00000602028 H3BS24 57 aa2.81□□□□□ -1.96
TIMM50-218ENST00000602028 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.56□□□□□ -2
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