RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

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Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.7□□□□□ -1.66
FCHO1-221ENST00000597512 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.7□□□□□ -1.66
FCHO1-221ENST00000597512 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.69□□□□□ -1.66
FCHO1-221ENST00000597512 MT1GP13640 62 aa4.67□□□□□ -1.66
FCHO1-221ENST00000597512 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.67□□□□□ -1.66
FCHO1-221ENST00000597512 MT1MQ8N339 61 aa4.64□□□□□ -1.67
FCHO1-221ENST00000597512 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.59□□□□□ -1.67
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.58□□□□□ -1.68
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-9P26371 169 aa4.56□□□□□ -1.68
FCHO1-221ENST00000597512 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
FCHO1-221ENST00000597512 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.47□□□□□ -1.69
FCHO1-221ENST00000597512 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.45□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.44□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.42□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 SPRR2EP22531 72 aa4.41□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 SPRR2BP35325 72 aa4.41□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 SPRR2AP35326 72 aa4.41□□□□□ -1.7
FCHO1-221ENST00000597512 MDN1Q9NU22 5596 aa4.4□□□□□ -1.71
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.38□□□□□ -1.71
FCHO1-221ENST00000597512 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
FCHO1-221ENST00000597512 SPRR2DP22532 72 aa4.24□□□□□ -1.73
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.74
FCHO1-221ENST00000597512 MT1AP04731 61 aa4.13□□□□□ -1.75
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.11□□□□□ -1.75
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.1□□□□□ -1.75
FCHO1-221ENST00000597512 LCE3BQ5TA77 95 aa4.05□□□□□ -1.76
FCHO1-221ENST00000597512 NEBP20929 6669 aa4.02□□□□□ -1.77
FCHO1-221ENST00000597512 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP12-4P60329 112 aa3.91□□□□□ -1.78
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FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.86□□□□□ -1.79
FCHO1-221ENST00000597512 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.81□□□□□ -1.8
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FCHO1-221ENST00000597512 MT3P25713 68 aa3.74□□□□□ -1.81
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.72□□□□□ -1.81
FCHO1-221ENST00000597512 MT4P47944 62 aa3.68□□□□□ -1.82
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.67□□□□□ -1.82
FCHO1-221ENST00000597512 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.67□□□□□ -1.82
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FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.61□□□□□ -1.83
FCHO1-221ENST00000597512 LCE1DQ5T752 114 aa3.57□□□□□ -1.84
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.54□□□□□ -1.84
FCHO1-221ENST00000597512 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.52□□□□□ -1.85
FCHO1-221ENST00000597512 PRM1P04553 51 aa3.5□□□□□ -1.85
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.46□□□□□ -1.86
FCHO1-221ENST00000597512 LCE1EQ5T753 118 aa3.3□□□□□ -1.88
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.08□□□□□ -1.92
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.03□□□□□ -1.92
FCHO1-221ENST00000597512 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.92
FCHO1-221ENST00000597512 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.02□□□□□ -1.93
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3□□□□□ -1.93
FCHO1-221ENST00000597512 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3□□□□□ -1.93
FCHO1-221ENST00000597512 LCE1CQ5T751 118 aa2.97□□□□□ -1.93
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.97□□□□□ -1.93
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-8O75690 187 aa2.96□□□□□ -1.94
FCHO1-221ENST00000597512 LCE1FQ5T754 118 aa2.89□□□□□ -1.95
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.89□□□□□ -1.95
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.68□□□□□ -1.98
FCHO1-221ENST00000597512 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.65□□□□□ -1.99
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.62□□□□□ -1.99
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.6□□□□□ -1.99
FCHO1-221ENST00000597512 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.58□□□□□ -2
FCHO1-221ENST00000597512 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.43□□□□□ -2.02
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.39□□□□□ -2.03
FCHO1-221ENST00000597512 PHGR1C9JFL3 82 aa2.24□□□□□ -2.05
FCHO1-221ENST00000597512 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.15□□□□□ -2.06
FCHO1-221ENST00000597512 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
FCHO1-221ENST00000597512 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.45□□□□□ -2.18
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