RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594202.5

FCHO1-206, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,214 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-206ENST00000594202 MT1EP04732 61 aa5.29□□□□□ -1.56
FCHO1-206ENST00000594202 MT1LQ93083 61 aa5.27□□□□□ -1.57
FCHO1-206ENST00000594202 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.22□□□□□ -1.57
FCHO1-206ENST00000594202 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
FCHO1-206ENST00000594202 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
FCHO1-206ENST00000594202 MT1GP13640 62 aa5.13□□□□□ -1.59
FCHO1-206ENST00000594202 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.12□□□□□ -1.59
FCHO1-206ENST00000594202 MDN1Q9NU22 5596 aa5.12□□□□□ -1.59
FCHO1-206ENST00000594202 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.08□□□□□ -1.6
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.07□□□□□ -1.6
FCHO1-206ENST00000594202 MT1MQ8N339 61 aa4.98□□□□□ -1.61
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.98□□□□□ -1.61
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.86□□□□□ -1.63
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.86□□□□□ -1.63
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.86□□□□□ -1.63
FCHO1-206ENST00000594202 INE1O15225 51 aa4.85□□□□□ -1.63
FCHO1-206ENST00000594202 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.78□□□□□ -1.64
FCHO1-206ENST00000594202 LCE3BQ5TA77 95 aa4.75□□□□□ -1.65
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.7□□□□□ -1.66
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.68□□□□□ -1.66
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FCHO1-206ENST00000594202 SPRR2AP35326 72 aa4.66□□□□□ -1.66
FCHO1-206ENST00000594202 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.62□□□□□ -1.67
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-9P26371 169 aa4.58□□□□□ -1.68
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.57□□□□□ -1.68
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP12-4P60329 112 aa4.51□□□□□ -1.69
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.5□□□□□ -1.69
FCHO1-206ENST00000594202 SPRR2DP22532 72 aa4.44□□□□□ -1.7
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.36□□□□□ -1.71
FCHO1-206ENST00000594202 MT1AP04731 61 aa4.35□□□□□ -1.71
FCHO1-206ENST00000594202 NEBP20929 6669 aa4.26□□□□□ -1.73
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
FCHO1-206ENST00000594202 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.23□□□□□ -1.73
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.19□□□□□ -1.74
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.17□□□□□ -1.74
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FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.12□□□□□ -1.75
FCHO1-206ENST00000594202 MT4P47944 62 aa4.1□□□□□ -1.75
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.01□□□□□ -1.77
FCHO1-206ENST00000594202 PRM1P04553 51 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-206ENST00000594202 MT3P25713 68 aa3.95□□□□□ -1.78
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FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.72□□□□□ -1.81
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.72□□□□□ -1.81
FCHO1-206ENST00000594202 LCE4AQ5TA78 99 aa3.68□□□□□ -1.82
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.67□□□□□ -1.82
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.55□□□□□ -1.84
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FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.12□□□□□ -1.91
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.1□□□□□ -1.91
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FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-8O75690 187 aa3.02□□□□□ -1.93
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.98□□□□□ -1.93
FCHO1-206ENST00000594202 LCE1CQ5T751 118 aa2.97□□□□□ -1.93
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.89□□□□□ -1.95
FCHO1-206ENST00000594202 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.89□□□□□ -1.95
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.85□□□□□ -1.95
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.81□□□□□ -1.96
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.62□□□□□ -1.99
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.58□□□□□ -2
FCHO1-206ENST00000594202 LCE1FQ5T754 118 aa2.48□□□□□ -2.01
FCHO1-206ENST00000594202 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
FCHO1-206ENST00000594202 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.26□□□□□ -2.05
FCHO1-206ENST00000594202 PHGR1C9JFL3 82 aa2.26□□□□□ -2.05
FCHO1-206ENST00000594202 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.47□□□□□ -2.17
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