RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 RNF213Q63HN8 5207 aa2.41□□□□□ -2.02
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.41□□□□□ -2.02
SEH1L-210ENST00000592582 MT1FP04733 61 aa2.39□□□□□ -2.03
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.39□□□□□ -2.03
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.39□□□□□ -2.03
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP12-3P60328 96 aa2.37□□□□□ -2.03
SEH1L-210ENST00000592582 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.37□□□□□ -2.03
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.36□□□□□ -2.03
SEH1L-210ENST00000592582 MT1BP07438 61 aa2.3□□□□□ -2.04
SEH1L-210ENST00000592582 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.3□□□□□ -2.04
SEH1L-210ENST00000592582 MT1XP80297 61 aa2.28□□□□□ -2.04
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP10-5P60370 271 aa2.27□□□□□ -2.05
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.23□□□□□ -2.05
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.23□□□□□ -2.05
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.22□□□□□ -2.05
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
SEH1L-210ENST00000592582 SSPOA2VEC9 5147 aa2.19□□□□□ -2.06
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.16□□□□□ -2.06
SEH1L-210ENST00000592582 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.14□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.14□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.12□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.12□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 SPRR2EP22531 72 aa2.11□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 SPRR2BP35325 72 aa2.11□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 SPRR2AP35326 72 aa2.11□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.09□□□□□ -2.07
SEH1L-210ENST00000592582 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.08□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 SPRR2DP22532 72 aa2.07□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 USH2AO75445 5202 aa2.07□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 NEBP20929 6669 aa2.06□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.04□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.03□□□□□ -2.08
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP12-4P60329 112 aa2.02□□□□□ -2.09
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.01□□□□□ -2.09
SEH1L-210ENST00000592582 MT1EP04732 61 aa2□□□□□ -2.09
SEH1L-210ENST00000592582 MT1LQ93083 61 aa2□□□□□ -2.09
SEH1L-210ENST00000592582 LCE1EQ5T753 118 aa1.99□□□□□ -2.09
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa1.95□□□□□ -2.1
SEH1L-210ENST00000592582 MT1GP13640 62 aa1.95□□□□□ -2.1
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.92□□□□□ -2.1
SEH1L-210ENST00000592582 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
SEH1L-210ENST00000592582 MT1MQ8N339 61 aa1.88□□□□□ -2.11
SEH1L-210ENST00000592582 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.81□□□□□ -2.12
SEH1L-210ENST00000592582 PRM1P04553 51 aa1.8□□□□□ -2.12
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa1.8□□□□□ -2.12
SEH1L-210ENST00000592582 KMT2DO14686 5537 aa1.78□□□□□ -2.12
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
SEH1L-210ENST00000592582 MT1AP04731 61 aa1.76□□□□□ -2.13
SEH1L-210ENST00000592582 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.75□□□□□ -2.13
SEH1L-210ENST00000592582 MT4P47944 62 aa1.75□□□□□ -2.13
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-9P26371 169 aa1.73□□□□□ -2.13
SEH1L-210ENST00000592582 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.72□□□□□ -2.13
SEH1L-210ENST00000592582 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.69□□□□□ -2.14
SEH1L-210ENST00000592582 MDN1Q9NU22 5596 aa1.69□□□□□ -2.14
SEH1L-210ENST00000592582 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.68□□□□□ -2.14
SEH1L-210ENST00000592582 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.67□□□□□ -2.14
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.66□□□□□ -2.14
SEH1L-210ENST00000592582 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.65□□□□□ -2.14
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.65□□□□□ -2.15
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.63□□□□□ -2.15
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.62□□□□□ -2.15
SEH1L-210ENST00000592582 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.59□□□□□ -2.16
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.57□□□□□ -2.16
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.5□□□□□ -2.17
SEH1L-210ENST00000592582 MUC5ACP98088 5654 aa1.42□□□□□ -2.18
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.41□□□□□ -2.18
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.39□□□□□ -2.19
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.37□□□□□ -2.19
SEH1L-210ENST00000592582 LCE1CQ5T751 118 aa1.3□□□□□ -2.2
SEH1L-210ENST00000592582 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.3□□□□□ -2.2
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP5-8O75690 187 aa1.25□□□□□ -2.21
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.24□□□□□ -2.21
SEH1L-210ENST00000592582 PHGR1C9JFL3 82 aa1.21□□□□□ -2.22
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.12□□□□□ -2.23
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.1□□□□□ -2.23
SEH1L-210ENST00000592582 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.71□□□□□ -2.3
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