RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.26□□□□□ -1.73
SNHG25-201ENST00000580828 LCE4AQ5TA78 99 aa4.21□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP12-3P60328 96 aa4.2□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.2□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.19□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 LCE1DQ5T752 114 aa4.18□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.17□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 K7ERS5 55 aa4.16□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.16□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 V9GYY9 64 aa4.16□□□□□ -1.74
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.13□□□□□ -1.75
SNHG25-201ENST00000580828 MT4P47944 62 aa4.12□□□□□ -1.75
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.12□□□□□ -1.75
SNHG25-201ENST00000580828 Q1T7F1 81 aa4.11□□□□□ -1.75
SNHG25-201ENST00000580828 PSPHP1O15172 72 aa4.1□□□□□ -1.75
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.08□□□□□ -1.76
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.07□□□□□ -1.76
SNHG25-201ENST00000580828 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.06□□□□□ -1.76
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.04□□□□□ -1.76
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.02□□□□□ -1.77
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.01□□□□□ -1.77
SNHG25-201ENST00000580828 A6NED7 52 aa3.98□□□□□ -1.77
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.93□□□□□ -1.78
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.91□□□□□ -1.78
SNHG25-201ENST00000580828 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.91□□□□□ -1.78
SNHG25-201ENST00000580828 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.89□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP12-4P60329 112 aa3.88□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.88□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.86□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.86□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 ROMO1P60602 79 aa3.85□□□□□ -1.79
SNHG25-201ENST00000580828 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.8
SNHG25-201ENST00000580828 PCP4P48539 62 aa3.76□□□□□ -1.81
SNHG25-201ENST00000580828 MT1AP04731 61 aa3.69□□□□□ -1.82
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.65□□□□□ -1.83
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.62□□□□□ -1.83
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.61□□□□□ -1.83
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.57□□□□□ -1.84
SNHG25-201ENST00000580828 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.55□□□□□ -1.84
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.55□□□□□ -1.84
SNHG25-201ENST00000580828 MUC5ACP98088 5654 aa3.51□□□□□ -1.85
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.49□□□□□ -1.85
SNHG25-201ENST00000580828 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.43□□□□□ -1.86
SNHG25-201ENST00000580828 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-8O75690 187 aa3.42□□□□□ -1.86
SNHG25-201ENST00000580828 MT3P25713 68 aa3.39□□□□□ -1.87
SNHG25-201ENST00000580828 BRK1Q8WUW1 75 aa3.37□□□□□ -1.87
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.33□□□□□ -1.88
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.23□□□□□ -1.89
SNHG25-201ENST00000580828 PMAIP1Q13794 54 aa3.19□□□□□ -1.9
SNHG25-201ENST00000580828 LCE1EQ5T753 118 aa3.13□□□□□ -1.91
SNHG25-201ENST00000580828 PRAC1Q96KF2 57 aa3.04□□□□□ -1.92
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.92□□□□□ -1.94
SNHG25-201ENST00000580828 PRO0628Q9UI54 55 aa2.91□□□□□ -1.94
SNHG25-201ENST00000580828 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.9□□□□□ -1.95
SNHG25-201ENST00000580828 LCE1CQ5T751 118 aa2.89□□□□□ -1.95
SNHG25-201ENST00000580828 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.8□□□□□ -1.96
SNHG25-201ENST00000580828 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.79□□□□□ -1.96
SNHG25-201ENST00000580828 SVIPQ8NHG7 77 aa2.67□□□□□ -1.98
SNHG25-201ENST00000580828 LUZP6Q538Z0 58 aa2.64□□□□□ -1.99
SNHG25-201ENST00000580828 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.63□□□□□ -1.99
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.63□□□□□ -1.99
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.63□□□□□ -1.99
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.61□□□□□ -1.99
SNHG25-201ENST00000580828 LCE1FQ5T754 118 aa2.57□□□□□ -2
SNHG25-201ENST00000580828 PHGR1C9JFL3 82 aa2.42□□□□□ -2.02
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.41□□□□□ -2.02
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.18□□□□□ -2.06
SNHG25-201ENST00000580828 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.12□□□□□ -2.07
SNHG25-201ENST00000580828 NDUFAF8A1L188 74 aa2.02□□□□□ -2.09
SNHG25-201ENST00000580828 PRM1P04553 51 aa1.95□□□□□ -2.1
SNHG25-201ENST00000580828 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.9□□□□□ -2.11
SNHG25-201ENST00000580828 INE1O15225 51 aa1.65□□□□□ -2.15
SNHG25-201ENST00000580828 A0A0A0MQY5 61 aa1.59□□□□□ -2.15
SNHG25-201ENST00000580828 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.51□□□□□ -2.17
SNHG25-201ENST00000580828 H3BS24 57 aa1.21□□□□□ -2.22
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