RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.26□□□□□ -1.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa8.26□□□□□ -1.09
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.2□□□□□ -1.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.2□□□□□ -1.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.2□□□□□ -1.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.18□□□□□ -1.1
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.14□□□□□ -1.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.11□□□□□ -1.11
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1GP13640 62 aa8.03□□□□□ -1.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa8.03□□□□□ -1.12
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1MQ8N339 61 aa8.02□□□□□ -1.13
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.91□□□□□ -1.14
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.84□□□□□ -1.15
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MDN1Q9NU22 5596 aa7.79□□□□□ -1.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-9P26371 169 aa7.78□□□□□ -1.16
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.67□□□□□ -1.18
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR2EP22531 72 aa7.59□□□□□ -1.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR2BP35325 72 aa7.59□□□□□ -1.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR2AP35326 72 aa7.59□□□□□ -1.19
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.55□□□□□ -1.2
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.44□□□□□ -1.22
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPRR2DP22532 72 aa7.29□□□□□ -1.24
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP12-4P60329 112 aa7.21□□□□□ -1.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT1AP04731 61 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3BQ5TA77 95 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7□□□□□ -1.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NEBP20929 6669 aa6.98□□□□□ -1.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.97□□□□□ -1.29
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.74□□□□□ -1.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.71□□□□□ -1.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.64□□□□□ -1.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.59□□□□□ -1.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.52□□□□□ -1.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT3P25713 68 aa6.43□□□□□ -1.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MT4P47944 62 aa6.4□□□□□ -1.38
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PRM1P04553 51 aa6.4□□□□□ -1.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.37□□□□□ -1.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE4AQ5TA78 99 aa6.35□□□□□ -1.39
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.33□□□□□ -1.4
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.23□□□□□ -1.41
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.21□□□□□ -1.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.21□□□□□ -1.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.17□□□□□ -1.42
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE1DQ5T752 114 aa6.15□□□□□ -1.43
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.05□□□□□ -1.44
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.93□□□□□ -1.46
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE1EQ5T753 118 aa5.41□□□□□ -1.54
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC5ACP98088 5654 aa5.33□□□□□ -1.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.28□□□□□ -1.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.28□□□□□ -1.56
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.21□□□□□ -1.57
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.2□□□□□ -1.58
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.14□□□□□ -1.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.12□□□□□ -1.59
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE1CQ5T751 118 aa5.08□□□□□ -1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-8O75690 187 aa5.06□□□□□ -1.6
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.89□□□□□ -1.63
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.64□□□□□ -1.67
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.55□□□□□ -1.68
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.45□□□□□ -1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.44□□□□□ -1.7
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.27□□□□□ -1.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.23□□□□□ -1.73
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.07□□□□□ -1.76
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 PHGR1C9JFL3 82 aa3.83□□□□□ -1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LCE1FQ5T754 118 aa3.82□□□□□ -1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.79□□□□□ -1.8
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 106.7 ms