RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576677.5

TBCD-222, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 1 (best)

Gene TBCD, Length 1,926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-222	ENST00000576677	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	7.59	□□□□□ -1.19
TBCD-222	ENST00000576677	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		7.54	□□□□□ -1.2
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		7.52	□□□□□ -1.2
TBCD-222	ENST00000576677	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		7.52	□□□□□ -1.2
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		7.48	□□□□□ -1.21
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		7.46	□□□□□ -1.21
TBCD-222	ENST00000576677	MT1G	P13640	62 aa		7.46	□□□□□ -1.21
TBCD-222	ENST00000576677	MT1M	Q8N339	61 aa		7.41	□□□□□ -1.22
TBCD-222	ENST00000576677	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		7.36	□□□□□ -1.23
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-9	P26371	169 aa		7.33	□□□□□ -1.24
TBCD-222	ENST00000576677	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	7.32	□□□□□ -1.24
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.31	□□□□□ -1.24
TBCD-222	ENST00000576677	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		7.15	□□□□□ -1.26
TBCD-222	ENST00000576677	MDN1	Q9NU22	5596 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TBCD-222	ENST00000576677	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		7.13	□□□□□ -1.27
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	7.11	□□□□□ -1.27
TBCD-222	ENST00000576677	INE1	O15225	51 aa		7.07	□□□□□ -1.28
TBCD-222	ENST00000576677	SPRR2E	P22531	72 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TBCD-222	ENST00000576677	SPRR2B	P35325	72 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TBCD-222	ENST00000576677	SPRR2A	P35326	72 aa		7.05	□□□□□ -1.28
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		7.03	□□□□□ -1.28
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		7.02	□□□□□ -1.29
TBCD-222	ENST00000576677	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
TBCD-222	ENST00000576677	SPRR2D	P22532	72 aa		6.78	□□□□□ -1.32
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.76	□□□□□ -1.33
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
TBCD-222	ENST00000576677	MT1A	P04731	61 aa		6.59	□□□□□ -1.35
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.56	□□□□□ -1.36
TBCD-222	ENST00000576677	NEB	P20929	6669 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TBCD-222	ENST00000576677	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.48	□□□□□ -1.37
TBCD-222	ENST00000576677	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.29	□□□□□ -1.4
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.24	□□□□□ -1.41
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.19	□□□□□ -1.42
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		6.16	□□□□□ -1.42
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.08	□□□□□ -1.44
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.99	□□□□□ -1.45
TBCD-222	ENST00000576677	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.98	□□□□□ -1.45
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.97	□□□□□ -1.45
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.96	□□□□□ -1.46
TBCD-222	ENST00000576677	MT3	P25713	68 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TBCD-222	ENST00000576677	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.95	□□□□□ -1.46
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TBCD-222	ENST00000576677	MT4	P47944	62 aa		5.89	□□□□□ -1.47
TBCD-222	ENST00000576677	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TBCD-222	ENST00000576677	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.74	□□□□□ -1.49
TBCD-222	ENST00000576677	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		5.71	□□□□□ -1.5
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.68	□□□□□ -1.5
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.56	□□□□□ -1.52
TBCD-222	ENST00000576677	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.52	□□□□□ -1.53
TBCD-222	ENST00000576677	PRM1	P04553	51 aa		5.23	□□□□□ -1.57
TBCD-222	ENST00000576677	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TBCD-222	ENST00000576677	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TBCD-222	ENST00000576677	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TBCD-222	ENST00000576677	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TBCD-222	ENST00000576677	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
TBCD-222	ENST00000576677	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.76	□□□□□ -1.65
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.75	□□□□□ -1.65
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.72	□□□□□ -1.65
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.48	□□□□□ -1.69
TBCD-222	ENST00000576677	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.38	□□□□□ -1.71
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.29	□□□□□ -1.72
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.17	□□□□□ -1.74
TBCD-222	ENST00000576677	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TBCD-222	ENST00000576677	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.83	□□□□□ -1.8
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TBCD-222	ENST00000576677	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TBCD-222	ENST00000576677	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TBCD-222	ENST00000576677	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TBCD-222	ENST00000576677	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.31	□□□□□ -2.04

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