RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576589.1

NOMO3-217, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

TSL 5

Gene NOMO3, Length 683 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-217ENST00000576589 K7ERS5 55 aa10.13□□□□□ -0.79
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa10.13□□□□□ -0.79
NOMO3-217ENST00000576589 MT1GP13640 62 aa10.12□□□□□ -0.79
NOMO3-217ENST00000576589 PCP4P48539 62 aa10.06□□□□□ -0.8
NOMO3-217ENST00000576589 MT1LQ93083 61 aa10.05□□□□□ -0.8
NOMO3-217ENST00000576589 PP632Q6XCG6 107 aa10.04□□□□□ -0.8
NOMO3-217ENST00000576589 A6NED7 52 aa9.97□□□□□ -0.81
NOMO3-217ENST00000576589 RPS28P62857 69 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.95□□□□□ -0.82
NOMO3-217ENST00000576589 MT1MQ8N339 61 aa9.95□□□□□ -0.82
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP12-3P60328 96 aa9.89□□□□□ -0.83
NOMO3-217ENST00000576589 LCE1DQ5T752 114 aa9.83□□□□□ -0.84
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa9.72□□□□□ -0.85
NOMO3-217ENST00000576589 LCE4AQ5TA78 99 aa9.68□□□□□ -0.86
NOMO3-217ENST00000576589 HMCN1Q96RW7 5635 aa9.68□□□□□ -0.86
NOMO3-217ENST00000576589 MT4P47944 62 aa9.66□□□□□ -0.86
NOMO3-217ENST00000576589 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.61□□□□□ -0.87
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa9.59□□□□□ -0.87
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.58□□□□□ -0.88
NOMO3-217ENST00000576589 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa9.49□□□□□ -0.89
NOMO3-217ENST00000576589 ROMO1P60602 79 aa9.48□□□□□ -0.89
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa9.42□□□□□ -0.9
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa9.36□□□□□ -0.91
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa9.34□□□□□ -0.91
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.33□□□□□ -0.92
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa9.33□□□□□ -0.92
NOMO3-217ENST00000576589 LCE3CQ5T5A8 94 aa9.12□□□□□ -0.95
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
NOMO3-217ENST00000576589 LOC100996750A0A140TA64 210 aa9.06□□□□□ -0.96
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa9.06□□□□□ -0.96
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa9.04□□□□□ -0.96
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa8.93□□□□□ -0.98
NOMO3-217ENST00000576589 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa8.83□□□□□ -1
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP12-4P60329 112 aa8.82□□□□□ -1
NOMO3-217ENST00000576589 BRK1Q8WUW1 75 aa8.8□□□□□ -1
NOMO3-217ENST00000576589 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa8.6□□□□□ -1.03
NOMO3-217ENST00000576589 MT1AP04731 61 aa8.55□□□□□ -1.04
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa8.5□□□□□ -1.05
NOMO3-217ENST00000576589 PMAIP1Q13794 54 aa8.29□□□□□ -1.08
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa8.27□□□□□ -1.09
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa8.25□□□□□ -1.09
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-2Q701N4 177 aa8.22□□□□□ -1.09
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa8.07□□□□□ -1.12
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-8O75690 187 aa8□□□□□ -1.13
NOMO3-217ENST00000576589 PRAC1Q96KF2 57 aa7.95□□□□□ -1.14
NOMO3-217ENST00000576589 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
NOMO3-217ENST00000576589 MUC5ACP98088 5654 aa7.87□□□□□ -1.15
NOMO3-217ENST00000576589 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
NOMO3-217ENST00000576589 MT3P25713 68 aa7.83□□□□□ -1.16
NOMO3-217ENST00000576589 PRO0628Q9UI54 55 aa7.8□□□□□ -1.16
NOMO3-217ENST00000576589 OBSCNQ5VST9 7968 aa7.73□□□□□ -1.17
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.67□□□□□ -1.18
NOMO3-217ENST00000576589 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.44□□□□□ -1.22
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa7.42□□□□□ -1.22
NOMO3-217ENST00000576589 SVIPQ8NHG7 77 aa7.15□□□□□ -1.26
NOMO3-217ENST00000576589 LCE1EQ5T753 118 aa7.11□□□□□ -1.27
NOMO3-217ENST00000576589 LCE1BQ5T7P3 118 aa6.71□□□□□ -1.34
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.7□□□□□ -1.34
NOMO3-217ENST00000576589 LUZP6Q538Z0 58 aa6.68□□□□□ -1.34
NOMO3-217ENST00000576589 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.63□□□□□ -1.35
NOMO3-217ENST00000576589 LCE1CQ5T751 118 aa6.6□□□□□ -1.35
NOMO3-217ENST00000576589 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.29□□□□□ -1.4
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.16□□□□□ -1.42
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.94□□□□□ -1.46
NOMO3-217ENST00000576589 LCE1FQ5T754 118 aa5.82□□□□□ -1.48
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa5.58□□□□□ -1.52
NOMO3-217ENST00000576589 NDUFAF8A1L188 74 aa5.52□□□□□ -1.53
NOMO3-217ENST00000576589 PHGR1C9JFL3 82 aa5.48□□□□□ -1.53
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.1□□□□□ -1.59
NOMO3-217ENST00000576589 PRM1P04553 51 aa4.86□□□□□ -1.63
NOMO3-217ENST00000576589 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.78□□□□□ -1.64
NOMO3-217ENST00000576589 INE1O15225 51 aa4.44□□□□□ -1.7
NOMO3-217ENST00000576589 A0A0A0MQY5 61 aa4.43□□□□□ -1.7
NOMO3-217ENST00000576589 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa4.16□□□□□ -1.74
NOMO3-217ENST00000576589 H3BS24 57 aa3.97□□□□□ -1.77
NOMO3-217ENST00000576589 MUC16Q8WXI7 14507 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms