RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570063.5

RSRP1-222, Transcript of arginine and serine rich protein 1, human

TSL 5

Gene RSRP1, Length 1,821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSRP1-222	ENST00000570063	MT1L	Q93083	61 aa		6.3	□□□□□ -1.4
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		6.28	□□□□□ -1.4
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE3B	Q5TA77	95 aa		6.25	□□□□□ -1.41
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.2	□□□□□ -1.42
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.15	□□□□□ -1.42
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RSRP1-222	ENST00000570063	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RSRP1-222	ENST00000570063	MT1G	P13640	62 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RSRP1-222	ENST00000570063		A0A0A0MQY5	61 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RSRP1-222	ENST00000570063	MT1M	Q8N339	61 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RSRP1-222	ENST00000570063	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.96	□□□□□ -1.46
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.94	□□□□□ -1.46
RSRP1-222	ENST00000570063	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.9	□□□□□ -1.47
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE1D	Q5T752	114 aa		5.85	□□□□□ -1.47
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RSRP1-222	ENST00000570063	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.71	□□□□□ -1.49
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.66	□□□□□ -1.5
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.61	□□□□□ -1.51
RSRP1-222	ENST00000570063	INE1	O15225	51 aa		5.56	□□□□□ -1.52
RSRP1-222	ENST00000570063	SPRR2E	P22531	72 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RSRP1-222	ENST00000570063	SPRR2B	P35325	72 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RSRP1-222	ENST00000570063	SPRR2A	P35326	72 aa		5.55	□□□□□ -1.52
RSRP1-222	ENST00000570063	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.49	□□□□□ -1.53
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.46	□□□□□ -1.54
RSRP1-222	ENST00000570063	NEB	P20929	6669 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.35	□□□□□ -1.55
RSRP1-222	ENST00000570063	SPRR2D	P22532	72 aa		5.33	□□□□□ -1.56
RSRP1-222	ENST00000570063	MT1A	P04731	61 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.32	□□□□□ -1.56
RSRP1-222	ENST00000570063	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.01	□□□□□ -1.61
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.95	□□□□□ -1.62
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RSRP1-222	ENST00000570063	MT3	P25713	68 aa		4.77	□□□□□ -1.65
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.74	□□□□□ -1.65
RSRP1-222	ENST00000570063	MT4	P47944	62 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.57	□□□□□ -1.68
RSRP1-222	ENST00000570063	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RSRP1-222	ENST00000570063	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RSRP1-222	ENST00000570063	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RSRP1-222	ENST00000570063	PRM1	P04553	51 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RSRP1-222	ENST00000570063	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.06	□□□□□ -1.76
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RSRP1-222	ENST00000570063	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.96	□□□□□ -1.78
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.48	□□□□□ -1.85
RSRP1-222	ENST00000570063	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RSRP1-222	ENST00000570063	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
RSRP1-222	ENST00000570063	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.09	□□□□□ -1.92
RSRP1-222	ENST00000570063	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RSRP1-222	ENST00000570063	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RSRP1-222	ENST00000570063	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.58	□□□□□ -2
RSRP1-222	ENST00000570063	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.93	□□□□□ -2.1

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