RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568169.5

TCF4-238, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 870 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-238	ENST00000568169	SCGB1A1	P11684	91 aa		3.98	□□□□□ -1.77
TCF4-238	ENST00000568169	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		3.97	□□□□□ -1.77
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.87	□□□□□ -1.79
TCF4-238	ENST00000568169	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TCF4-238	ENST00000568169	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TCF4-238	ENST00000568169	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.85	□□□□□ -1.79
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		3.82	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	SERP2	Q8N6R1	65 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	SVIP	Q8NHG7	77 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	SNURF	Q9Y675	71 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TCF4-238	ENST00000568169	PCP4	P48539	62 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TCF4-238	ENST00000568169	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1B0GU33	70 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TCF4-238	ENST00000568169	SEC61G	P60059	68 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TCF4-238	ENST00000568169	TNP1	P09430	55 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TCF4-238	ENST00000568169	COX7C	P15954	63 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TCF4-238	ENST00000568169	COA5	Q86WW8	74 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.68	□□□□□ -1.82
TCF4-238	ENST00000568169		A0A0A0MQY5	61 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TCF4-238	ENST00000568169	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
TCF4-238	ENST00000568169	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TCF4-238	ENST00000568169		H7BZZ5	65 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TCF4-238	ENST00000568169	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		3.62	□□□□□ -1.83
TCF4-238	ENST00000568169		A8MU10	97 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TCF4-238	ENST00000568169	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TCF4-238	ENST00000568169		A0A1B0GU69	56 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	CCDC179	H3BU77	68 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
TCF4-238	ENST00000568169	TMEM258	P61165	79 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TCF4-238	ENST00000568169	MT1A	P04731	61 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TCF4-238	ENST00000568169	PRR15L	Q9BU68	103 aa		3.42	□□□□□ -1.86
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.41	□□□□□ -1.86
TCF4-238	ENST00000568169	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TCF4-238	ENST00000568169	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TCF4-238	ENST00000568169	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.36	□□□□□ -1.87
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TCF4-238	ENST00000568169	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCF4-238	ENST00000568169		V9GYY9	64 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TCF4-238	ENST00000568169	UQCR11	O14957	56 aa		3.29	□□□□□ -1.88
TCF4-238	ENST00000568169	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.24	□□□□□ -1.89
TCF4-238	ENST00000568169		Q1T7F1	81 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TCF4-238	ENST00000568169	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TCF4-238	ENST00000568169	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TCF4-238	ENST00000568169		K7ERS5	55 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TCF4-238	ENST00000568169	PSPHP1	O15172	72 aa		3.15	□□□□□ -1.91
TCF4-238	ENST00000568169		A6NED7	52 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TCF4-238	ENST00000568169	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.01	□□□□□ -1.93
TCF4-238	ENST00000568169	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3	□□□□□ -1.93
TCF4-238	ENST00000568169	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TCF4-238	ENST00000568169	ROMO1	P60602	79 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TCF4-238	ENST00000568169	PRO0628	Q9UI54	55 aa		2.9	□□□□□ -1.95
TCF4-238	ENST00000568169	BRK1	Q8WUW1	75 aa		2.87	□□□□□ -1.95
TCF4-238	ENST00000568169	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TCF4-238	ENST00000568169	PMAIP1	Q13794	54 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-238	ENST00000568169	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TCF4-238	ENST00000568169	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TCF4-238	ENST00000568169	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.43	□□□□□ -2.02
TCF4-238	ENST00000568169	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.37	□□□□□ -2.03
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.26	□□□□□ -2.05
TCF4-238	ENST00000568169	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.18	□□□□□ -2.06
TCF4-238	ENST00000568169	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.16	□□□□□ -2.06
TCF4-238	ENST00000568169	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.86	□□□□□ -2.11
TCF4-238	ENST00000568169	INE1	O15225	51 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TCF4-238	ENST00000568169	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.51	□□□□□ -2.17
TCF4-238	ENST00000568169	PRM1	P04553	51 aa		1.47	□□□□□ -2.17

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