RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT1MQ8N339 61 aa6.05□□□□□ -1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.05□□□□□ -1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE1DQ5T752 114 aa6.03□□□□□ -1.44
CCNDBP1-211ENST00000567434 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.02□□□□□ -1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 V9GYY9 64 aa6.01□□□□□ -1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.97□□□□□ -1.45
CCNDBP1-211ENST00000567434 K7ERS5 55 aa5.96□□□□□ -1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP12-3P60328 96 aa5.94□□□□□ -1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 Q1T7F1 81 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE4AQ5TA78 99 aa5.93□□□□□ -1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT4P47944 62 aa5.91□□□□□ -1.46
CCNDBP1-211ENST00000567434 PSPHP1O15172 72 aa5.89□□□□□ -1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.85□□□□□ -1.47
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.81□□□□□ -1.48
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.77□□□□□ -1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.74□□□□□ -1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 A6NED7 52 aa5.73□□□□□ -1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.72□□□□□ -1.49
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.7□□□□□ -1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.64□□□□□ -1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.62□□□□□ -1.51
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.58□□□□□ -1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.57□□□□□ -1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
CCNDBP1-211ENST00000567434 PCP4P48539 62 aa5.52□□□□□ -1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 ROMO1P60602 79 aa5.52□□□□□ -1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.47□□□□□ -1.53
CCNDBP1-211ENST00000567434 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.45□□□□□ -1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP12-4P60329 112 aa5.44□□□□□ -1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.44□□□□□ -1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.43□□□□□ -1.54
CCNDBP1-211ENST00000567434 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT1AP04731 61 aa5.2□□□□□ -1.58
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.13□□□□□ -1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.11□□□□□ -1.59
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.07□□□□□ -1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.06□□□□□ -1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.01□□□□□ -1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUC5ACP98088 5654 aa5□□□□□ -1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
CCNDBP1-211ENST00000567434 BRK1Q8WUW1 75 aa4.92□□□□□ -1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-8O75690 187 aa4.91□□□□□ -1.62
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.9□□□□□ -1.63
CCNDBP1-211ENST00000567434 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.82□□□□□ -1.64
CCNDBP1-211ENST00000567434 MT3P25713 68 aa4.77□□□□□ -1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.73□□□□□ -1.65
CCNDBP1-211ENST00000567434 PMAIP1Q13794 54 aa4.64□□□□□ -1.67
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.52□□□□□ -1.69
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRAC1Q96KF2 57 aa4.41□□□□□ -1.7
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE1EQ5T753 118 aa4.4□□□□□ -1.71
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRO0628Q9UI54 55 aa4.3□□□□□ -1.72
CCNDBP1-211ENST00000567434 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.12□□□□□ -1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.09□□□□□ -1.75
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE1CQ5T751 118 aa4.07□□□□□ -1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.07□□□□□ -1.76
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.96□□□□□ -1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 SVIPQ8NHG7 77 aa3.93□□□□□ -1.78
CCNDBP1-211ENST00000567434 LUZP6Q538Z0 58 aa3.83□□□□□ -1.8
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.75□□□□□ -1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.73□□□□□ -1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.68□□□□□ -1.82
CCNDBP1-211ENST00000567434 LCE1FQ5T754 118 aa3.6□□□□□ -1.83
CCNDBP1-211ENST00000567434 PHGR1C9JFL3 82 aa3.41□□□□□ -1.86
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.39□□□□□ -1.87
CCNDBP1-211ENST00000567434 H3BS24 57 aa3.04□□□□□ -1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.04□□□□□ -1.92
CCNDBP1-211ENST00000567434 NDUFAF8A1L188 74 aa2.98□□□□□ -1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.97□□□□□ -1.93
CCNDBP1-211ENST00000567434 PRM1P04553 51 aa2.79□□□□□ -1.96
CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.6□□□□□ -1.99
CCNDBP1-211ENST00000567434 A0A0A0MQY5 61 aa2.57□□□□□ -2
CCNDBP1-211ENST00000567434 INE1O15225 51 aa2.45□□□□□ -2.02
CCNDBP1-211ENST00000567434 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 239.9 ms