RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563726.5

RGL3-208, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator like 3, human

TSL 2

Gene RGL3, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		6	□□□□□ -1.45
RGL3-208	ENST00000563726	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
RGL3-208	ENST00000563726	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
RGL3-208	ENST00000563726	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.81	□□□□□ -1.48
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.8	□□□□□ -1.48
RGL3-208	ENST00000563726	MT1G	P13640	62 aa		5.74	□□□□□ -1.49
RGL3-208	ENST00000563726	MT1M	Q8N339	61 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RGL3-208	ENST00000563726	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.62	□□□□□ -1.51
RGL3-208	ENST00000563726	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.59	□□□□□ -1.52
RGL3-208	ENST00000563726	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		5.57	□□□□□ -1.52
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.5	□□□□□ -1.53
RGL3-208	ENST00000563726	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.49	□□□□□ -1.53
RGL3-208	ENST00000563726	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
RGL3-208	ENST00000563726	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.41	□□□□□ -1.54
RGL3-208	ENST00000563726	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.34	□□□□□ -1.56
RGL3-208	ENST00000563726	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
RGL3-208	ENST00000563726	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.29	□□□□□ -1.56
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.26	□□□□□ -1.57
RGL3-208	ENST00000563726	MT1A	P04731	61 aa		5.24	□□□□□ -1.57
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.22	□□□□□ -1.57
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.19	□□□□□ -1.58
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.16	□□□□□ -1.58
RGL3-208	ENST00000563726	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.14	□□□□□ -1.59
RGL3-208	ENST00000563726	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
RGL3-208	ENST00000563726	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		5.08	□□□□□ -1.6
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
RGL3-208	ENST00000563726	SPRR2E	P22531	72 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGL3-208	ENST00000563726	SPRR2B	P35325	72 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGL3-208	ENST00000563726	SPRR2A	P35326	72 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGL3-208	ENST00000563726	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		5.04	□□□□□ -1.6
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.98	□□□□□ -1.61
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.94	□□□□□ -1.62
RGL3-208	ENST00000563726	PRM1	P04553	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RGL3-208	ENST00000563726	SPRR2D	P22532	72 aa		4.84	□□□□□ -1.64
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RGL3-208	ENST00000563726	NEB	P20929	6669 aa		4.69	□□□□□ -1.66
RGL3-208	ENST00000563726	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RGL3-208	ENST00000563726	MT3	P25713	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67
RGL3-208	ENST00000563726	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.45	□□□□□ -1.7
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.42	□□□□□ -1.7
RGL3-208	ENST00000563726	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.41	□□□□□ -1.7
RGL3-208	ENST00000563726	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.38	□□□□□ -1.71
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.29	□□□□□ -1.72
RGL3-208	ENST00000563726	MT4	P47944	62 aa		4.27	□□□□□ -1.73
RGL3-208	ENST00000563726	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.21	□□□□□ -1.74
RGL3-208	ENST00000563726	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.16	□□□□□ -1.74
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.15	□□□□□ -1.75
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.99	□□□□□ -1.77
RGL3-208	ENST00000563726	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.72	□□□□□ -1.81
RGL3-208	ENST00000563726	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.68	□□□□□ -1.82
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RGL3-208	ENST00000563726	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.59	□□□□□ -1.84
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RGL3-208	ENST00000563726	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RGL3-208	ENST00000563726	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.51	□□□□□ -1.85
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.41	□□□□□ -1.86
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.38	□□□□□ -1.87
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.27	□□□□□ -1.89
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		3.16	□□□□□ -1.9
RGL3-208	ENST00000563726	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RGL3-208	ENST00000563726	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.94	□□□□□ -1.94
RGL3-208	ENST00000563726	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.88	□□□□□ -1.95
RGL3-208	ENST00000563726	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RGL3-208	ENST00000563726	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.61	□□□□□ -1.99
RGL3-208	ENST00000563726	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.78	□□□□□ -2.12

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