RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 SPRR2BP35325 72 aa3.24□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 SPRR2AP35326 72 aa3.24□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 A0A1B0GU69 56 aa3.23□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.23□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.21□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 A8MU10 97 aa3.19□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP12-1P59990 96 aa3.19□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.15□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.14□□□□□ -1.91
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LINS1-211ENST00000560941 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.13□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.13□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 SPRR2DP22532 72 aa3.12□□□□□ -1.91
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LINS1-211ENST00000560941 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.07□□□□□ -1.92
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LINS1-211ENST00000560941 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.94□□□□□ -1.94
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LINS1-211ENST00000560941 ROMO1P60602 79 aa2.73□□□□□ -1.97
LINS1-211ENST00000560941 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.65□□□□□ -1.99
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LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.41□□□□□ -2.02
LINS1-211ENST00000560941 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.4□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 PMAIP1Q13794 54 aa2.38□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 PRO0628Q9UI54 55 aa2.38□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.36□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.18□□□□□ -2.06
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.13□□□□□ -2.07
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LINS1-211ENST00000560941 MUC5ACP98088 5654 aa2.05□□□□□ -2.08
LINS1-211ENST00000560941 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
LINS1-211ENST00000560941 LUZP6Q538Z0 58 aa1.89□□□□□ -2.11
LINS1-211ENST00000560941 PHGR1C9JFL3 82 aa1.48□□□□□ -2.17
LINS1-211ENST00000560941 INE1O15225 51 aa1.48□□□□□ -2.17
LINS1-211ENST00000560941 PRM1P04553 51 aa1.43□□□□□ -2.18
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.08□□□□□ -2.24
LINS1-211ENST00000560941 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.02□□□□□ -2.25
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