RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560941.5

LINS1-211, Transcript of lines homolog 1, humanhuman

TSL 5

Gene LINS1, Length 588 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINS1-211ENST00000560941 SPRR2BP35325 72 aa3.24□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 SPRR2AP35326 72 aa3.24□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 A0A1B0GU69 56 aa3.23□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.23□□□□□ -1.89
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.21□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 A8MU10 97 aa3.19□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP12-1P59990 96 aa3.19□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
LINS1-211ENST00000560941 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.15□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.14□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.13□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 TMEM258P61165 79 aa3.13□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.13□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.13□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 SPRR2DP22532 72 aa3.12□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 PRR15LQ9BU68 103 aa3.12□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.08□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.07□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 MT1EP04732 61 aa3.04□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.04□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.04□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 A0A0A0MQY5 61 aa3.03□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 UQCR11O14957 56 aa3.03□□□□□ -1.92
LINS1-211ENST00000560941 PSPHP1O15172 72 aa3□□□□□ -1.93
LINS1-211ENST00000560941 TNP1P09430 55 aa3□□□□□ -1.93
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3□□□□□ -1.93
LINS1-211ENST00000560941 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.98□□□□□ -1.93
LINS1-211ENST00000560941 Q1T7F1 81 aa2.95□□□□□ -1.94
LINS1-211ENST00000560941 LCE1CQ5T751 118 aa2.94□□□□□ -1.94
LINS1-211ENST00000560941 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.94□□□□□ -1.94
LINS1-211ENST00000560941 V9GYY9 64 aa2.94□□□□□ -1.94
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LINS1-211ENST00000560941 PCP4P48539 62 aa2.92□□□□□ -1.94
LINS1-211ENST00000560941 MT1LQ93083 61 aa2.92□□□□□ -1.94
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LINS1-211ENST00000560941 MT1MQ8N339 61 aa2.9□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 K7ERS5 55 aa2.88□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 PP632Q6XCG6 107 aa2.88□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 A6NED7 52 aa2.87□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP12-3P60328 96 aa2.86□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-8O75690 187 aa2.85□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.84□□□□□ -1.95
LINS1-211ENST00000560941 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.83□□□□□ -1.96
LINS1-211ENST00000560941 NDUFAF8A1L188 74 aa2.8□□□□□ -1.96
LINS1-211ENST00000560941 SVIPQ8NHG7 77 aa2.79□□□□□ -1.96
LINS1-211ENST00000560941 MT4P47944 62 aa2.76□□□□□ -1.97
LINS1-211ENST00000560941 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.75□□□□□ -1.97
LINS1-211ENST00000560941 ROMO1P60602 79 aa2.73□□□□□ -1.97
LINS1-211ENST00000560941 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.65□□□□□ -1.99
LINS1-211ENST00000560941 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.59□□□□□ -1.99
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.56□□□□□ -2
LINS1-211ENST00000560941 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.55□□□□□ -2
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LINS1-211ENST00000560941 KRTAP12-4P60329 112 aa2.54□□□□□ -2
LINS1-211ENST00000560941 BRK1Q8WUW1 75 aa2.54□□□□□ -2
LINS1-211ENST00000560941 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.51□□□□□ -2.01
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.5□□□□□ -2.01
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.49□□□□□ -2.01
LINS1-211ENST00000560941 MT1AP04731 61 aa2.48□□□□□ -2.01
LINS1-211ENST00000560941 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.46□□□□□ -2.02
LINS1-211ENST00000560941 PRAC1Q96KF2 57 aa2.45□□□□□ -2.02
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.41□□□□□ -2.02
LINS1-211ENST00000560941 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.4□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 PMAIP1Q13794 54 aa2.38□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 PRO0628Q9UI54 55 aa2.38□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.36□□□□□ -2.03
LINS1-211ENST00000560941 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.18□□□□□ -2.06
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.13□□□□□ -2.07
LINS1-211ENST00000560941 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
LINS1-211ENST00000560941 MUC5ACP98088 5654 aa2.05□□□□□ -2.08
LINS1-211ENST00000560941 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.03□□□□□ -2.08
LINS1-211ENST00000560941 LUZP6Q538Z0 58 aa1.89□□□□□ -2.11
LINS1-211ENST00000560941 PHGR1C9JFL3 82 aa1.48□□□□□ -2.17
LINS1-211ENST00000560941 INE1O15225 51 aa1.48□□□□□ -2.17
LINS1-211ENST00000560941 PRM1P04553 51 aa1.43□□□□□ -2.18
LINS1-211ENST00000560941 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.08□□□□□ -2.24
LINS1-211ENST00000560941 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.02□□□□□ -2.25
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