RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558773.1

MFGE8-208, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 3

Gene MFGE8, Length 534 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-208ENST00000558773 TNP1P09430 55 aa6.94□□□□□ -1.3
MFGE8-208ENST00000558773 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.93□□□□□ -1.3
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.86□□□□□ -1.31
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.8□□□□□ -1.32
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.76□□□□□ -1.33
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP12-3P60328 96 aa6.73□□□□□ -1.33
MFGE8-208ENST00000558773 PRR15LQ9BU68 103 aa6.69□□□□□ -1.34
MFGE8-208ENST00000558773 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.67□□□□□ -1.34
MFGE8-208ENST00000558773 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.62□□□□□ -1.35
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.59□□□□□ -1.35
MFGE8-208ENST00000558773 CCDC179H3BU77 68 aa6.58□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.58□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.57□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.54□□□□□ -1.36
MFGE8-208ENST00000558773 UQCR11O14957 56 aa6.49□□□□□ -1.37
MFGE8-208ENST00000558773 H3BS24 57 aa6.47□□□□□ -1.37
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP12-4P60329 112 aa6.44□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.44□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.41□□□□□ -1.38
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.39□□□□□ -1.39
MFGE8-208ENST00000558773 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.31□□□□□ -1.4
MFGE8-208ENST00000558773 TMEM258P61165 79 aa6.3□□□□□ -1.4
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.23□□□□□ -1.41
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.22□□□□□ -1.41
MFGE8-208ENST00000558773 K7ERS5 55 aa6.21□□□□□ -1.42
MFGE8-208ENST00000558773 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.19□□□□□ -1.42
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.08□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.06□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 MT1AP04731 61 aa6.05□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 PSPHP1O15172 72 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.04□□□□□ -1.44
MFGE8-208ENST00000558773 V9GYY9 64 aa6.02□□□□□ -1.45
MFGE8-208ENST00000558773 Q1T7F1 81 aa6□□□□□ -1.45
MFGE8-208ENST00000558773 PCP4P48539 62 aa5.93□□□□□ -1.46
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.89□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-8O75690 187 aa5.88□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.87□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.86□□□□□ -1.47
MFGE8-208ENST00000558773 A6NED7 52 aa5.8□□□□□ -1.48
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.8□□□□□ -1.48
MFGE8-208ENST00000558773 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
MFGE8-208ENST00000558773 ROMO1P60602 79 aa5.77□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.76□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 MUC5ACP98088 5654 aa5.73□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
MFGE8-208ENST00000558773 A0A0A0MQY5 61 aa5.59□□□□□ -1.51
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.58□□□□□ -1.52
MFGE8-208ENST00000558773 MT3P25713 68 aa5.54□□□□□ -1.52
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.49□□□□□ -1.53
MFGE8-208ENST00000558773 LCE1EQ5T753 118 aa5.18□□□□□ -1.58
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.91□□□□□ -1.62
MFGE8-208ENST00000558773 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.83□□□□□ -1.64
MFGE8-208ENST00000558773 LCE1CQ5T751 118 aa4.8□□□□□ -1.64
MFGE8-208ENST00000558773 BRK1Q8WUW1 75 aa4.65□□□□□ -1.67
MFGE8-208ENST00000558773 PRAC1Q96KF2 57 aa4.63□□□□□ -1.67
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.49□□□□□ -1.69
MFGE8-208ENST00000558773 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.4□□□□□ -1.71
MFGE8-208ENST00000558773 PMAIP1Q13794 54 aa4.36□□□□□ -1.71
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.36□□□□□ -1.71
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
MFGE8-208ENST00000558773 LCE1FQ5T754 118 aa4.31□□□□□ -1.72
MFGE8-208ENST00000558773 NDUFAF8A1L188 74 aa4.15□□□□□ -1.75
MFGE8-208ENST00000558773 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.1□□□□□ -1.75
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4□□□□□ -1.77
MFGE8-208ENST00000558773 PRO0628Q9UI54 55 aa3.97□□□□□ -1.77
MFGE8-208ENST00000558773 PHGR1C9JFL3 82 aa3.94□□□□□ -1.78
MFGE8-208ENST00000558773 LUZP6Q538Z0 58 aa3.72□□□□□ -1.81
MFGE8-208ENST00000558773 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.67□□□□□ -1.82
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.66□□□□□ -1.82
MFGE8-208ENST00000558773 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.55□□□□□ -1.84
MFGE8-208ENST00000558773 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3□□□□□ -1.93
MFGE8-208ENST00000558773 PRM1P04553 51 aa2.93□□□□□ -1.94
MFGE8-208ENST00000558773 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.54□□□□□ -2
MFGE8-208ENST00000558773 INE1O15225 51 aa2.51□□□□□ -2.01
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.5 ms