RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.24□□□□□ -1.73
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PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.21□□□□□ -1.73
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PTPRR-209ENST00000549308 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.2□□□□□ -1.74
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PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRR-209ENST00000549308 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.38□□□□□ -2.03
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PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.36□□□□□ -2.03
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PTPRR-209ENST00000549308 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.73□□□□□ -2.13
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.58□□□□□ -2.16
PTPRR-209ENST00000549308 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.3 ms