RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 TNP1P09430 55 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-214ENST00000548849 K7ERU9 68 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-214ENST00000548849 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-214ENST00000548849 A8MU10 97 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-214ENST00000548849 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-214ENST00000548849 A0A1B0GU69 56 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-214ENST00000548849 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-214ENST00000548849 KRTAP12-3P60328 96 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
CS-214ENST00000548849 KRTAP12-4P60329 112 aa5.56□□□□□ -1.52
CS-214ENST00000548849 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CS-214ENST00000548849 H7BZZ5 65 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-214ENST00000548849 COX7CP15954 63 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-214ENST00000548849 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.44□□□□□ -1.54
CS-214ENST00000548849 PRR15LQ9BU68 103 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-214ENST00000548849 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.27□□□□□ -1.57
CS-214ENST00000548849 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.25□□□□□ -1.57
CS-214ENST00000548849 PCP4P48539 62 aa5.24□□□□□ -1.57
CS-214ENST00000548849 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.22□□□□□ -1.57
CS-214ENST00000548849 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.18□□□□□ -1.58
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.16□□□□□ -1.58
CS-214ENST00000548849 UQCR11O14957 56 aa5.14□□□□□ -1.59
CS-214ENST00000548849 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.12□□□□□ -1.59
CS-214ENST00000548849 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.11□□□□□ -1.59
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-8O75690 187 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-214ENST00000548849 MT1AP04731 61 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-214ENST00000548849 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.1□□□□□ -1.59
CS-214ENST00000548849 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.08□□□□□ -1.6
CS-214ENST00000548849 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CS-214ENST00000548849 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
CS-214ENST00000548849 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
CS-214ENST00000548849 MUC5ACP98088 5654 aa5.03□□□□□ -1.6
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.01□□□□□ -1.61
CS-214ENST00000548849 CCDC179H3BU77 68 aa5□□□□□ -1.61
CS-214ENST00000548849 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5□□□□□ -1.61
CS-214ENST00000548849 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-214ENST00000548849 K7ERS5 55 aa4.99□□□□□ -1.61
CS-214ENST00000548849 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.98□□□□□ -1.61
CS-214ENST00000548849 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.95□□□□□ -1.62
CS-214ENST00000548849 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.92□□□□□ -1.62
CS-214ENST00000548849 A0A0A0MQY5 61 aa4.88□□□□□ -1.63
CS-214ENST00000548849 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-214ENST00000548849 TMEM258P61165 79 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-214ENST00000548849 MT3P25713 68 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-214ENST00000548849 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-214ENST00000548849 PSPHP1O15172 72 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-214ENST00000548849 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-214ENST00000548849 Q1T7F1 81 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-214ENST00000548849 V9GYY9 64 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-214ENST00000548849 ROMO1P60602 79 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-214ENST00000548849 A6NED7 52 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-214ENST00000548849 LCE1EQ5T753 118 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-214ENST00000548849 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.2□□□□□ -1.74
CS-214ENST00000548849 LCE1CQ5T751 118 aa4.06□□□□□ -1.76
CS-214ENST00000548849 PRAC1Q96KF2 57 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-214ENST00000548849 NDUFAF8A1L188 74 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-214ENST00000548849 LCE1FQ5T754 118 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-214ENST00000548849 PRO0628Q9UI54 55 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-214ENST00000548849 BRK1Q8WUW1 75 aa3.68□□□□□ -1.82
CS-214ENST00000548849 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
CS-214ENST00000548849 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-214ENST00000548849 PHGR1C9JFL3 82 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-214ENST00000548849 PMAIP1Q13794 54 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-214ENST00000548849 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-214ENST00000548849 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-214ENST00000548849 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-214ENST00000548849 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-214ENST00000548849 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-214ENST00000548849 LUZP6Q538Z0 58 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-214ENST00000548849 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-214ENST00000548849 PRM1P04553 51 aa2.31□□□□□ -2.04
CS-214ENST00000548849 INE1O15225 51 aa2.22□□□□□ -2.05
CS-214ENST00000548849 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.11□□□□□ -2.07
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