RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544662.1

PUS1-211, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

TSL 3

Gene PUS1, Length 836 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-211ENST00000544662 Q1T7F1 81 aa7.77□□□□□ -1.17
PUS1-211ENST00000544662 MT1MQ8N339 61 aa7.73□□□□□ -1.17
PUS1-211ENST00000544662 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PUS1-211ENST00000544662 K7ERS5 55 aa7.68□□□□□ -1.18
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP12-3P60328 96 aa7.62□□□□□ -1.19
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.61□□□□□ -1.19
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.57□□□□□ -1.2
PUS1-211ENST00000544662 A6NED7 52 aa7.53□□□□□ -1.2
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.53□□□□□ -1.2
PUS1-211ENST00000544662 PCP4P48539 62 aa7.46□□□□□ -1.22
PUS1-211ENST00000544662 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.44□□□□□ -1.22
PUS1-211ENST00000544662 LCE4AQ5TA78 99 aa7.4□□□□□ -1.22
PUS1-211ENST00000544662 LCE1DQ5T752 114 aa7.36□□□□□ -1.23
PUS1-211ENST00000544662 SVIPQ8NHG7 77 aa7.33□□□□□ -1.24
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.32□□□□□ -1.24
PUS1-211ENST00000544662 MT4P47944 62 aa7.3□□□□□ -1.24
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.29□□□□□ -1.24
PUS1-211ENST00000544662 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.29□□□□□ -1.24
PUS1-211ENST00000544662 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.24□□□□□ -1.25
PUS1-211ENST00000544662 ROMO1P60602 79 aa7.19□□□□□ -1.26
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.17□□□□□ -1.26
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.16□□□□□ -1.26
PUS1-211ENST00000544662 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.14□□□□□ -1.27
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.12□□□□□ -1.27
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PUS1-211ENST00000544662 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.04□□□□□ -1.28
PUS1-211ENST00000544662 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.04□□□□□ -1.28
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.87□□□□□ -1.31
PUS1-211ENST00000544662 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.87□□□□□ -1.31
PUS1-211ENST00000544662 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.85□□□□□ -1.31
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP12-4P60329 112 aa6.85□□□□□ -1.31
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.77□□□□□ -1.33
PUS1-211ENST00000544662 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.67□□□□□ -1.34
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.64□□□□□ -1.35
PUS1-211ENST00000544662 MT1AP04731 61 aa6.64□□□□□ -1.35
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.59□□□□□ -1.35
PUS1-211ENST00000544662 BRK1Q8WUW1 75 aa6.57□□□□□ -1.36
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.49□□□□□ -1.37
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.41□□□□□ -1.38
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.4□□□□□ -1.38
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.27□□□□□ -1.41
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.23□□□□□ -1.41
PUS1-211ENST00000544662 PMAIP1Q13794 54 aa6.17□□□□□ -1.42
PUS1-211ENST00000544662 MT3P25713 68 aa6.06□□□□□ -1.44
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-8O75690 187 aa6.03□□□□□ -1.44
PUS1-211ENST00000544662 PRAC1Q96KF2 57 aa5.96□□□□□ -1.46
PUS1-211ENST00000544662 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.81□□□□□ -1.48
PUS1-211ENST00000544662 PRO0628Q9UI54 55 aa5.77□□□□□ -1.49
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.72□□□□□ -1.49
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.69□□□□□ -1.5
PUS1-211ENST00000544662 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PUS1-211ENST00000544662 MUC5ACP98088 5654 aa5.6□□□□□ -1.51
PUS1-211ENST00000544662 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
PUS1-211ENST00000544662 LCE1EQ5T753 118 aa5.53□□□□□ -1.52
PUS1-211ENST00000544662 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.51□□□□□ -1.53
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.22□□□□□ -1.57
PUS1-211ENST00000544662 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.21□□□□□ -1.58
PUS1-211ENST00000544662 A0A0A0MQY5 61 aa5.15□□□□□ -1.59
PUS1-211ENST00000544662 LCE1CQ5T751 118 aa5.12□□□□□ -1.59
PUS1-211ENST00000544662 H3BS24 57 aa5.09□□□□□ -1.59
PUS1-211ENST00000544662 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.09□□□□□ -1.59
PUS1-211ENST00000544662 LUZP6Q538Z0 58 aa4.99□□□□□ -1.61
PUS1-211ENST00000544662 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.81□□□□□ -1.64
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.7□□□□□ -1.66
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.63□□□□□ -1.67
PUS1-211ENST00000544662 LCE1FQ5T754 118 aa4.47□□□□□ -1.69
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.34□□□□□ -1.71
PUS1-211ENST00000544662 NDUFAF8A1L188 74 aa4.07□□□□□ -1.76
PUS1-211ENST00000544662 PHGR1C9JFL3 82 aa4□□□□□ -1.77
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.97□□□□□ -1.77
PUS1-211ENST00000544662 PRM1P04553 51 aa3.68□□□□□ -1.82
PUS1-211ENST00000544662 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.6□□□□□ -1.83
PUS1-211ENST00000544662 INE1O15225 51 aa3.31□□□□□ -1.88
PUS1-211ENST00000544662 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.98□□□□□ -1.93
PUS1-211ENST00000544662 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.59□□□□□ -1.99
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