RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPRR2AP35326 72 aa6.31□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.3□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSPHP1O15172 72 aa6.28□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.28□□□□□ -1.4
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNP1P09430 55 aa6.22□□□□□ -1.41
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.21□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.2□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 K7ERS5 55 aa6.19□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.15□□□□□ -1.42
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A6NED7 52 aa6.13□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT1EP04732 61 aa6.11□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.11□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPRR2DP22532 72 aa6.11□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.11□□□□□ -1.43
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa6.07□□□□□ -1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.04□□□□□ -1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE3AQ5TA76 89 aa6.04□□□□□ -1.44
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.02□□□□□ -1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.01□□□□□ -1.45
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.93□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.92□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT1GP13640 62 aa5.91□□□□□ -1.46
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PP632Q6XCG6 107 aa5.89□□□□□ -1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT1LQ93083 61 aa5.87□□□□□ -1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE1EQ5T753 118 aa5.86□□□□□ -1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP12-3P60328 96 aa5.85□□□□□ -1.47
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ROMO1P60602 79 aa5.78□□□□□ -1.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT1MQ8N339 61 aa5.78□□□□□ -1.48
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT3P25713 68 aa5.73□□□□□ -1.49
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.55□□□□□ -1.52
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BRK1Q8WUW1 75 aa5.52□□□□□ -1.53
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.4□□□□□ -1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.4□□□□□ -1.54
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A0A0MQY5 61 aa5.33□□□□□ -1.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT4P47944 62 aa5.27□□□□□ -1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE1FQ5T754 118 aa5.27□□□□□ -1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.24□□□□□ -1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.24□□□□□ -1.57
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PMAIP1Q13794 54 aa5.2□□□□□ -1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.18□□□□□ -1.58
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.11□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP12-4P60329 112 aa5.11□□□□□ -1.59
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRO0628Q9UI54 55 aa5.06□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.05□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa5.03□□□□□ -1.6
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.02□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MT1AP04731 61 aa5.02□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.94□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.92□□□□□ -1.62
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRAC1Q96KF2 57 aa4.9□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.85□□□□□ -1.63
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.8□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.79□□□□□ -1.64
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.66□□□□□ -1.66
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.65□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.6□□□□□ -1.67
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.53□□□□□ -1.68
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NDUFAF8A1L188 74 aa4.5□□□□□ -1.69
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP5-8O75690 187 aa4.39□□□□□ -1.71
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LUZP6Q538Z0 58 aa4.2□□□□□ -1.74
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MUC5ACP98088 5654 aa4.09□□□□□ -1.75
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
GMDS-AS1-211ENST00000533653 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.94□□□□□ -1.78
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE1CQ5T751 118 aa3.87□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.87□□□□□ -1.79
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.26□□□□□ -1.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.16□□□□□ -1.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INE1O15225 51 aa3.1□□□□□ -1.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PHGR1C9JFL3 82 aa2.99□□□□□ -1.93
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRM1P04553 51 aa2.94□□□□□ -1.94
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.15□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.91□□□□□ -2.1
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