RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFAF8A1L188 74 aa4.51□□□□□ -1.69
UBASH3B-208ENST00000533451 A8MU10 97 aa4.51□□□□□ -1.69
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP12-1P59990 96 aa4.5□□□□□ -1.69
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE1EQ5T753 118 aa4.5□□□□□ -1.69
UBASH3B-208ENST00000533451 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.48□□□□□ -1.69
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.47□□□□□ -1.69
UBASH3B-208ENST00000533451 MDN1Q9NU22 5596 aa4.45□□□□□ -1.7
UBASH3B-208ENST00000533451 UQCR11O14957 56 aa4.39□□□□□ -1.71
UBASH3B-208ENST00000533451 SPRR2DP22532 72 aa4.38□□□□□ -1.71
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.35□□□□□ -1.71
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.35□□□□□ -1.71
UBASH3B-208ENST00000533451 PSPHP1O15172 72 aa4.33□□□□□ -1.72
UBASH3B-208ENST00000533451 V9GYY9 64 aa4.33□□□□□ -1.72
UBASH3B-208ENST00000533451 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.32□□□□□ -1.72
UBASH3B-208ENST00000533451 TNP1P09430 55 aa4.3□□□□□ -1.72
UBASH3B-208ENST00000533451 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.3□□□□□ -1.72
UBASH3B-208ENST00000533451 K7ERS5 55 aa4.26□□□□□ -1.73
UBASH3B-208ENST00000533451 Q1T7F1 81 aa4.26□□□□□ -1.73
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.26□□□□□ -1.73
UBASH3B-208ENST00000533451 MT1EP04732 61 aa4.25□□□□□ -1.73
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.25□□□□□ -1.73
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE3AQ5TA76 89 aa4.22□□□□□ -1.73
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.21□□□□□ -1.74
UBASH3B-208ENST00000533451 A6NED7 52 aa4.2□□□□□ -1.74
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.19□□□□□ -1.74
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE1FQ5T754 118 aa4.18□□□□□ -1.74
UBASH3B-208ENST00000533451 PP632Q6XCG6 107 aa4.12□□□□□ -1.75
UBASH3B-208ENST00000533451 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
UBASH3B-208ENST00000533451 MT1GP13640 62 aa4.1□□□□□ -1.75
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.1□□□□□ -1.75
UBASH3B-208ENST00000533451 MT1LQ93083 61 aa4.08□□□□□ -1.76
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP12-3P60328 96 aa4.06□□□□□ -1.76
UBASH3B-208ENST00000533451 MT1MQ8N339 61 aa4.05□□□□□ -1.76
UBASH3B-208ENST00000533451 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.03□□□□□ -1.76
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4□□□□□ -1.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.99□□□□□ -1.77
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.97□□□□□ -1.77
UBASH3B-208ENST00000533451 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
UBASH3B-208ENST00000533451 ROMO1P60602 79 aa3.94□□□□□ -1.78
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.9□□□□□ -1.79
UBASH3B-208ENST00000533451 MT4P47944 62 aa3.83□□□□□ -1.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.83□□□□□ -1.8
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.8□□□□□ -1.8
UBASH3B-208ENST00000533451 BRK1Q8WUW1 75 aa3.76□□□□□ -1.81
UBASH3B-208ENST00000533451 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.71□□□□□ -1.82
UBASH3B-208ENST00000533451 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.69□□□□□ -1.82
UBASH3B-208ENST00000533451 PRO0628Q9UI54 55 aa3.69□□□□□ -1.82
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
UBASH3B-208ENST00000533451 LUZP6Q538Z0 58 aa3.62□□□□□ -1.83
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP12-4P60329 112 aa3.6□□□□□ -1.83
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.56□□□□□ -1.84
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.55□□□□□ -1.84
UBASH3B-208ENST00000533451 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.55□□□□□ -1.84
UBASH3B-208ENST00000533451 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.53□□□□□ -1.84
UBASH3B-208ENST00000533451 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.52□□□□□ -1.85
UBASH3B-208ENST00000533451 PMAIP1Q13794 54 aa3.51□□□□□ -1.85
UBASH3B-208ENST00000533451 MT1AP04731 61 aa3.48□□□□□ -1.85
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.46□□□□□ -1.86
UBASH3B-208ENST00000533451 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.43□□□□□ -1.86
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.3□□□□□ -1.88
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.28□□□□□ -1.88
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.28□□□□□ -1.88
UBASH3B-208ENST00000533451 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.15□□□□□ -1.91
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP5-8O75690 187 aa3.08□□□□□ -1.92
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.03□□□□□ -1.92
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE1CQ5T751 118 aa2.96□□□□□ -1.94
UBASH3B-208ENST00000533451 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.96□□□□□ -1.94
UBASH3B-208ENST00000533451 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.94
UBASH3B-208ENST00000533451 MUC5ACP98088 5654 aa2.9□□□□□ -1.95
UBASH3B-208ENST00000533451 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
UBASH3B-208ENST00000533451 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.47□□□□□ -2.01
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.24□□□□□ -2.05
UBASH3B-208ENST00000533451 INE1O15225 51 aa2.08□□□□□ -2.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PHGR1C9JFL3 82 aa2.06□□□□□ -2.08
UBASH3B-208ENST00000533451 PRM1P04553 51 aa2.03□□□□□ -2.08
UBASH3B-208ENST00000533451 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.53□□□□□ -2.16
UBASH3B-208ENST00000533451 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.3□□□□□ -2.2
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