RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532581.5

GRAMD1B-208, Transcript of GRAM domain containing 1B, human

TSL 2

Gene GRAMD1B, Length 2,615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MT1E	P04732	61 aa		4.51	□□□□□ -1.69
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.47	□□□□□ -1.69
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GRAMD1B-208	ENST00000532581	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		4.3	□□□□□ -1.72
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MT1M	Q8N339	61 aa		4.21	□□□□□ -1.74
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MT1G	P13640	62 aa		4.2	□□□□□ -1.74
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
GRAMD1B-208	ENST00000532581	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		4.13	□□□□□ -1.75
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.12	□□□□□ -1.75
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.05	□□□□□ -1.76
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.99	□□□□□ -1.77
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.9	□□□□□ -1.79
GRAMD1B-208	ENST00000532581	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MT1A	P04731	61 aa		3.86	□□□□□ -1.79
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.82	□□□□□ -1.8
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.8	□□□□□ -1.8
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.72	□□□□□ -1.81
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.7	□□□□□ -1.82
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.7	□□□□□ -1.82
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.69	□□□□□ -1.82
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPRR2E	P22531	72 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPRR2B	P35325	72 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPRR2A	P35326	72 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PRM1	P04553	51 aa		3.59	□□□□□ -1.83
GRAMD1B-208	ENST00000532581	NEB	P20929	6669 aa		3.58	□□□□□ -1.84
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GRAMD1B-208	ENST00000532581	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GRAMD1B-208	ENST00000532581	SPRR2D	P22532	72 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.43	□□□□□ -1.86
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MT3	P25713	68 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.28	□□□□□ -1.88
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.23	□□□□□ -1.89
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GRAMD1B-208	ENST00000532581	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.06	□□□□□ -1.92
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.05	□□□□□ -1.92
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.02	□□□□□ -1.93
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MT4	P47944	62 aa		3.02	□□□□□ -1.93
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE1D	Q5T752	114 aa		3	□□□□□ -1.93
GRAMD1B-208	ENST00000532581	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.9	□□□□□ -1.95
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.89	□□□□□ -1.95
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.88	□□□□□ -1.95
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GRAMD1B-208	ENST00000532581	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.75	□□□□□ -1.97
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.72	□□□□□ -1.97
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.7	□□□□□ -1.98
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.7	□□□□□ -1.98
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.66	□□□□□ -1.98
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.63	□□□□□ -1.99
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.62	□□□□□ -1.99
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.56	□□□□□ -2
GRAMD1B-208	ENST00000532581	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.51	□□□□□ -2.01
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.5	□□□□□ -2.01
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.48	□□□□□ -2.01
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.47	□□□□□ -2.01
GRAMD1B-208	ENST00000532581	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.46	□□□□□ -2.02
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.39	□□□□□ -2.03
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.38	□□□□□ -2.03
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.26	□□□□□ -2.05
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.26	□□□□□ -2.05
GRAMD1B-208	ENST00000532581	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.21	□□□□□ -2.06
GRAMD1B-208	ENST00000532581	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.94	□□□□□ -2.1
GRAMD1B-208	ENST00000532581	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.31	□□□□□ -2.2

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