RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524534.5

PTPRK-217, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 2,441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRK-217ENST00000524534 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRK-217ENST00000524534 MT1GP13640 62 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRK-217ENST00000524534 MT1MQ8N339 61 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRK-217ENST00000524534 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP12-4P60329 112 aa3.57□□□□□ -1.84
PTPRK-217ENST00000524534 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-217ENST00000524534 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.55□□□□□ -1.84
PTPRK-217ENST00000524534 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.5□□□□□ -1.85
PTPRK-217ENST00000524534 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.48□□□□□ -1.85
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PTPRK-217ENST00000524534 LCE4AQ5TA78 99 aa3.41□□□□□ -1.86
PTPRK-217ENST00000524534 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.4□□□□□ -1.86
PTPRK-217ENST00000524534 MT1AP04731 61 aa3.4□□□□□ -1.87
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.38□□□□□ -1.87
PTPRK-217ENST00000524534 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.34□□□□□ -1.87
PTPRK-217ENST00000524534 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRK-217ENST00000524534 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRK-217ENST00000524534 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.26□□□□□ -1.89
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.23□□□□□ -1.89
PTPRK-217ENST00000524534 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.2□□□□□ -1.9
PTPRK-217ENST00000524534 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.18□□□□□ -1.9
PTPRK-217ENST00000524534 PRM1P04553 51 aa3.17□□□□□ -1.9
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
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PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-9P26371 169 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRK-217ENST00000524534 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.05□□□□□ -1.92
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PTPRK-217ENST00000524534 SPRR2BP35325 72 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-217ENST00000524534 SPRR2AP35326 72 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRK-217ENST00000524534 MT3P25713 68 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.92□□□□□ -1.94
PTPRK-217ENST00000524534 SPRR2DP22532 72 aa2.91□□□□□ -1.94
PTPRK-217ENST00000524534 LCE1DQ5T752 114 aa2.83□□□□□ -1.96
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.82□□□□□ -1.96
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.77□□□□□ -1.97
PTPRK-217ENST00000524534 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.76□□□□□ -1.97
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.74□□□□□ -1.97
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.69□□□□□ -1.98
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.62□□□□□ -1.99
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.58□□□□□ -2
PTPRK-217ENST00000524534 LCE1FQ5T754 118 aa2.58□□□□□ -2
PTPRK-217ENST00000524534 MT4P47944 62 aa2.56□□□□□ -2
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PTPRK-217ENST00000524534 MUC5ACP98088 5654 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRK-217ENST00000524534 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.4□□□□□ -2.02
PTPRK-217ENST00000524534 LCE1EQ5T753 118 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRK-217ENST00000524534 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.34□□□□□ -2.03
PTPRK-217ENST00000524534 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRK-217ENST00000524534 LCE1CQ5T751 118 aa2.27□□□□□ -2.05
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.17□□□□□ -2.06
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.03□□□□□ -2.08
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.02□□□□□ -2.09
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-8O75690 187 aa2.01□□□□□ -2.09
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.95□□□□□ -2.1
PTPRK-217ENST00000524534 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.93□□□□□ -2.1
PTPRK-217ENST00000524534 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.88□□□□□ -2.11
PTPRK-217ENST00000524534 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.85□□□□□ -2.11
PTPRK-217ENST00000524534 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.84□□□□□ -2.11
PTPRK-217ENST00000524534 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.83□□□□□ -2.12
PTPRK-217ENST00000524534 PHGR1C9JFL3 82 aa1.67□□□□□ -2.14
PTPRK-217ENST00000524534 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.18□□□□□ -2.22
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