RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523270.1

CNOT8-223, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 8, human

TSL 4

Gene CNOT8, Length 575 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT8-223	ENST00000523270	PP632	Q6XCG6	107 aa		7.23	□□□□□ -1.25
CNOT8-223	ENST00000523270		Q1T7F1	81 aa		7.21	□□□□□ -1.26
CNOT8-223	ENST00000523270		V9GYY9	64 aa		7.19	□□□□□ -1.26
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		7.17	□□□□□ -1.26
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP12-3	P60328	96 aa		7.12	□□□□□ -1.27
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		7.11	□□□□□ -1.27
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		7.06	□□□□□ -1.28
CNOT8-223	ENST00000523270		K7ERS5	55 aa		7.05	□□□□□ -1.28
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.04	□□□□□ -1.28
CNOT8-223	ENST00000523270	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		7.03	□□□□□ -1.28
CNOT8-223	ENST00000523270		A6NED7	52 aa		6.97	□□□□□ -1.29
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.95	□□□□□ -1.3
CNOT8-223	ENST00000523270	PCP4	P48539	62 aa		6.92	□□□□□ -1.3
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.91	□□□□□ -1.3
CNOT8-223	ENST00000523270	MT4	P47944	62 aa		6.88	□□□□□ -1.31
CNOT8-223	ENST00000523270	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	6.87	□□□□□ -1.31
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.86	□□□□□ -1.31
CNOT8-223	ENST00000523270	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.83	□□□□□ -1.32
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.77	□□□□□ -1.33
CNOT8-223	ENST00000523270	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.75	□□□□□ -1.33
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.72	□□□□□ -1.33
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.68	□□□□□ -1.34
CNOT8-223	ENST00000523270	ROMO1	P60602	79 aa		6.67	□□□□□ -1.34
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
CNOT8-223	ENST00000523270	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.66	□□□□□ -1.34
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		6.6	□□□□□ -1.35
CNOT8-223	ENST00000523270	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.59	□□□□□ -1.36
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		6.57	□□□□□ -1.36
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.47	□□□□□ -1.37
CNOT8-223	ENST00000523270	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.4	□□□□□ -1.38
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.39	□□□□□ -1.39
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.38	□□□□□ -1.39
CNOT8-223	ENST00000523270	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.37	□□□□□ -1.39
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.29	□□□□□ -1.4
CNOT8-223	ENST00000523270	MT1A	P04731	61 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		6.22	□□□□□ -1.41
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.11	□□□□□ -1.43
CNOT8-223	ENST00000523270	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.08	□□□□□ -1.44
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		6.04	□□□□□ -1.44
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.99	□□□□□ -1.45
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.9	□□□□□ -1.46
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.86	□□□□□ -1.47
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CNOT8-223	ENST00000523270	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.69	□□□□□ -1.5
CNOT8-223	ENST00000523270	MT3	P25713	68 aa		5.65	□□□□□ -1.5
CNOT8-223	ENST00000523270	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.58	□□□□□ -1.52
CNOT8-223	ENST00000523270	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.54	□□□□□ -1.52
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CNOT8-223	ENST00000523270	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.38	□□□□□ -1.55
CNOT8-223	ENST00000523270	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CNOT8-223	ENST00000523270	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CNOT8-223	ENST00000523270	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.32	□□□□□ -1.56
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CNOT8-223	ENST00000523270	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.31	□□□□□ -1.56
CNOT8-223	ENST00000523270		H3BS24	57 aa		5.23	□□□□□ -1.57
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE1E	Q5T753	118 aa		5.14	□□□□□ -1.59
CNOT8-223	ENST00000523270	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		5.08	□□□□□ -1.6
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CNOT8-223	ENST00000523270	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.47	□□□□□ -1.69
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.35	□□□□□ -1.71
CNOT8-223	ENST00000523270		A0A0A0MQY5	61 aa		4.29	□□□□□ -1.72
CNOT8-223	ENST00000523270	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		4.09	□□□□□ -1.75
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.77	□□□□□ -1.81
CNOT8-223	ENST00000523270	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.76	□□□□□ -1.81
CNOT8-223	ENST00000523270	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.75	□□□□□ -1.81
CNOT8-223	ENST00000523270	PRM1	P04553	51 aa		3.45	□□□□□ -1.86
CNOT8-223	ENST00000523270	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.44	□□□□□ -1.86
CNOT8-223	ENST00000523270	INE1	O15225	51 aa		2.94	□□□□□ -1.94
CNOT8-223	ENST00000523270	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.77	□□□□□ -1.97
CNOT8-223	ENST00000523270	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.46	□□□□□ -2.02

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