RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514705.5

TSPAN17-208, Transcript of tetraspanin 17, human

TSL 2

Gene TSPAN17, Length 4,445 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT1G	P13640	62 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT1E	P04732	61 aa		4.6	□□□□□ -1.67
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPRR2E	P22531	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPRR2B	P35325	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPRR2A	P35326	72 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.55	□□□□□ -1.68
TSPAN17-208	ENST00000514705	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.5	□□□□□ -1.69
TSPAN17-208	ENST00000514705	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.47	□□□□□ -1.69
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.44	□□□□□ -1.7
TSPAN17-208	ENST00000514705	SPRR2D	P22532	72 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TSPAN17-208	ENST00000514705	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.42	□□□□□ -1.7
TSPAN17-208	ENST00000514705	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT1M	Q8N339	61 aa		4.34	□□□□□ -1.71
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.32	□□□□□ -1.72
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.31	□□□□□ -1.72
TSPAN17-208	ENST00000514705	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.27	□□□□□ -1.73
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.26	□□□□□ -1.73
TSPAN17-208	ENST00000514705	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.25	□□□□□ -1.73
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.24	□□□□□ -1.73
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.19	□□□□□ -1.74
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.13	□□□□□ -1.75
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.09	□□□□□ -1.75
TSPAN17-208	ENST00000514705	PRM1	P04553	51 aa		4.05	□□□□□ -1.76
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.01	□□□□□ -1.77
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4	□□□□□ -1.77
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT1A	P04731	61 aa		3.92	□□□□□ -1.78
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT4	P47944	62 aa		3.9	□□□□□ -1.78
TSPAN17-208	ENST00000514705	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.83	□□□□□ -1.8
TSPAN17-208	ENST00000514705	NEB	P20929	6669 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TSPAN17-208	ENST00000514705	MT3	P25713	68 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.4	□□□□□ -1.87
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.24	□□□□□ -1.89
TSPAN17-208	ENST00000514705	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TSPAN17-208	ENST00000514705	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.89	□□□□□ -1.95
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TSPAN17-208	ENST00000514705	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TSPAN17-208	ENST00000514705	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.67	□□□□□ -1.98
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.66	□□□□□ -1.98
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.57	□□□□□ -2
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.57	□□□□□ -2
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.55	□□□□□ -2
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.38	□□□□□ -2.03
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.35	□□□□□ -2.03
TSPAN17-208	ENST00000514705	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.3	□□□□□ -2.04
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.29	□□□□□ -2.04
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.28	□□□□□ -2.04
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
TSPAN17-208	ENST00000514705	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.21	□□□□□ -2.06
TSPAN17-208	ENST00000514705	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.94	□□□□□ -2.1
TSPAN17-208	ENST00000514705	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.26	□□□□□ -2.21

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