RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.02□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCP4P48539 62 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT1LQ93083 61 aa5.98□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.98□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE3AQ5TA76 89 aa5.97□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT1MQ8N339 61 aa5.97□□□□□ -1.45
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.96□□□□□ -1.46
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UQCR11O14957 56 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM258P61165 79 aa5.85□□□□□ -1.47
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.8□□□□□ -1.48
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP12-3P60328 96 aa5.77□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMCN1Q96RW7 5635 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT4P47944 62 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.75□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.73□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXC-AS3-202ENST00000513165 K7ERS5 55 aa5.62□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 V9GYY9 64 aa5.59□□□□□ -1.51
HOXC-AS3-202ENST00000513165 Q1T7F1 81 aa5.54□□□□□ -1.52
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PSPHP1O15172 72 aa5.52□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.51□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.5□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.46□□□□□ -1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.41□□□□□ -1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.4□□□□□ -1.54
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.39□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP12-4P60329 112 aa5.38□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A6NED7 52 aa5.34□□□□□ -1.55
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.33□□□□□ -1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.32□□□□□ -1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.29□□□□□ -1.56
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.26□□□□□ -1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ROMO1P60602 79 aa5.21□□□□□ -1.58
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT1AP04731 61 aa5.1□□□□□ -1.59
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.05□□□□□ -1.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.01□□□□□ -1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRK1Q8WUW1 75 aa4.99□□□□□ -1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.98□□□□□ -1.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.84□□□□□ -1.63
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-8O75690 187 aa4.79□□□□□ -1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRO0628Q9UI54 55 aa4.78□□□□□ -1.64
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.73□□□□□ -1.65
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PMAIP1Q13794 54 aa4.7□□□□□ -1.66
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MT3P25713 68 aa4.69□□□□□ -1.66
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC5ACP98088 5654 aa4.56□□□□□ -1.68
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.51□□□□□ -1.69
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.47□□□□□ -1.69
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRAC1Q96KF2 57 aa4.4□□□□□ -1.71
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE1EQ5T753 118 aa4.34□□□□□ -1.71
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SVIPQ8NHG7 77 aa4.28□□□□□ -1.72
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE1CQ5T751 118 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.02□□□□□ -1.77
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0A0MQY5 61 aa3.85□□□□□ -1.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.84□□□□□ -1.79
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.83□□□□□ -1.8
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LUZP6Q538Z0 58 aa3.66□□□□□ -1.82
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.6□□□□□ -1.83
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LCE1FQ5T754 118 aa3.57□□□□□ -1.84
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NDUFAF8A1L188 74 aa3.45□□□□□ -1.86
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.34□□□□□ -1.87
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PHGR1C9JFL3 82 aa3.17□□□□□ -1.9
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.15□□□□□ -1.91
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.89□□□□□ -1.95
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INE1O15225 51 aa2.85□□□□□ -1.95
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PRM1P04553 51 aa2.63□□□□□ -1.99
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.43□□□□□ -2.02
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.06□□□□□ -2.08
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