RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505685.1

ZBED3-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene ZBED3, Length 432 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-202ENST00000505685 A8MU10 97 aa3.62□□□□□ -1.83
ZBED3-202ENST00000505685 SPRR2EP22531 72 aa3.62□□□□□ -1.83
ZBED3-202ENST00000505685 SPRR2BP35325 72 aa3.62□□□□□ -1.83
ZBED3-202ENST00000505685 SPRR2AP35326 72 aa3.62□□□□□ -1.83
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.59□□□□□ -1.83
ZBED3-202ENST00000505685 Q1T7F1 81 aa3.56□□□□□ -1.84
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.55□□□□□ -1.84
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.55□□□□□ -1.84
ZBED3-202ENST00000505685 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.54□□□□□ -1.84
ZBED3-202ENST00000505685 TNP1P09430 55 aa3.53□□□□□ -1.84
ZBED3-202ENST00000505685 K7ERS5 55 aa3.51□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 SPRR2DP22532 72 aa3.51□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 PSPHP1O15172 72 aa3.5□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.5□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.48□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.48□□□□□ -1.85
ZBED3-202ENST00000505685 MT1EP04732 61 aa3.46□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.46□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.44□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.43□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.43□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 A6NED7 52 aa3.42□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.41□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 LCE3AQ5TA76 89 aa3.41□□□□□ -1.86
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.4□□□□□ -1.87
ZBED3-202ENST00000505685 MT1GP13640 62 aa3.39□□□□□ -1.87
ZBED3-202ENST00000505685 PP632Q6XCG6 107 aa3.38□□□□□ -1.87
ZBED3-202ENST00000505685 MT1LQ93083 61 aa3.33□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP12-3P60328 96 aa3.32□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 LCE1EQ5T753 118 aa3.31□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.31□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 MT3P25713 68 aa3.28□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 MT1MQ8N339 61 aa3.28□□□□□ -1.88
ZBED3-202ENST00000505685 PRO0628Q9UI54 55 aa3.26□□□□□ -1.89
ZBED3-202ENST00000505685 ROMO1P60602 79 aa3.25□□□□□ -1.89
ZBED3-202ENST00000505685 LCE1FQ5T754 118 aa3.19□□□□□ -1.9
ZBED3-202ENST00000505685 PMAIP1Q13794 54 aa3.16□□□□□ -1.9
ZBED3-202ENST00000505685 PRAC1Q96KF2 57 aa3.13□□□□□ -1.91
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.13□□□□□ -1.91
ZBED3-202ENST00000505685 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.11□□□□□ -1.91
ZBED3-202ENST00000505685 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.11□□□□□ -1.91
ZBED3-202ENST00000505685 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.06□□□□□ -1.92
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.06□□□□□ -1.92
ZBED3-202ENST00000505685 BRK1Q8WUW1 75 aa3.05□□□□□ -1.92
ZBED3-202ENST00000505685 MT4P47944 62 aa3.02□□□□□ -1.93
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.01□□□□□ -1.93
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
ZBED3-202ENST00000505685 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
ZBED3-202ENST00000505685 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.96□□□□□ -1.94
ZBED3-202ENST00000505685 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.96□□□□□ -1.94
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP12-4P60329 112 aa2.95□□□□□ -1.94
ZBED3-202ENST00000505685 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.94□□□□□ -1.94
ZBED3-202ENST00000505685 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.91□□□□□ -1.94
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ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.8□□□□□ -1.96
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.79□□□□□ -1.96
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ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.69□□□□□ -1.98
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP5-8O75690 187 aa2.66□□□□□ -1.98
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.65□□□□□ -1.99
ZBED3-202ENST00000505685 MUC5ACP98088 5654 aa2.48□□□□□ -2.01
ZBED3-202ENST00000505685 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
ZBED3-202ENST00000505685 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
ZBED3-202ENST00000505685 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.25□□□□□ -2.05
ZBED3-202ENST00000505685 LCE1CQ5T751 118 aa2.22□□□□□ -2.05
ZBED3-202ENST00000505685 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.22□□□□□ -2.05
ZBED3-202ENST00000505685 INE1O15225 51 aa2.14□□□□□ -2.07
ZBED3-202ENST00000505685 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.86□□□□□ -2.11
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.84□□□□□ -2.11
ZBED3-202ENST00000505685 PHGR1C9JFL3 82 aa1.7□□□□□ -2.14
ZBED3-202ENST00000505685 PRM1P04553 51 aa1.63□□□□□ -2.15
ZBED3-202ENST00000505685 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.27□□□□□ -2.21
ZBED3-202ENST00000505685 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 182.9 ms