RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494815.1

TSPAN4-212, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,187 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.59□□□□□ -1.35
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.59□□□□□ -1.35
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.57□□□□□ -1.36
TSPAN4-212ENST00000494815 MT1LQ93083 61 aa6.55□□□□□ -1.36
TSPAN4-212ENST00000494815 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.41□□□□□ -1.38
TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.4□□□□□ -1.39
TSPAN4-212ENST00000494815 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.37□□□□□ -1.39
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.37□□□□□ -1.39
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.34□□□□□ -1.39
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.34□□□□□ -1.4
TSPAN4-212ENST00000494815 MT1GP13640 62 aa6.33□□□□□ -1.4
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-9P26371 169 aa6.29□□□□□ -1.4
TSPAN4-212ENST00000494815 MT1MQ8N339 61 aa6.25□□□□□ -1.41
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.24□□□□□ -1.41
TSPAN4-212ENST00000494815 NEBP20929 6669 aa6.16□□□□□ -1.42
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.12□□□□□ -1.43
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.1□□□□□ -1.43
TSPAN4-212ENST00000494815 MDN1Q9NU22 5596 aa6.1□□□□□ -1.43
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TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR2BP35325 72 aa6.02□□□□□ -1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR2AP35326 72 aa6.02□□□□□ -1.45
TSPAN4-212ENST00000494815 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.95□□□□□ -1.46
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TSPAN4-212ENST00000494815 SPRR2DP22532 72 aa5.8□□□□□ -1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.8□□□□□ -1.48
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
TSPAN4-212ENST00000494815 MT1AP04731 61 aa5.56□□□□□ -1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.56□□□□□ -1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE3BQ5TA77 95 aa5.55□□□□□ -1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP12-4P60329 112 aa5.53□□□□□ -1.52
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.5□□□□□ -1.53
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TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.3□□□□□ -1.56
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.26□□□□□ -1.57
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.21□□□□□ -1.58
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TSPAN4-212ENST00000494815 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.05□□□□□ -1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.04□□□□□ -1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 MT3P25713 68 aa5.04□□□□□ -1.6
TSPAN4-212ENST00000494815 MT4P47944 62 aa5.02□□□□□ -1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE1DQ5T752 114 aa5.02□□□□□ -1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.01□□□□□ -1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.98□□□□□ -1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 PRM1P04553 51 aa4.98□□□□□ -1.61
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.94□□□□□ -1.62
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.84□□□□□ -1.64
TSPAN4-212ENST00000494815 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.78□□□□□ -1.64
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.75□□□□□ -1.65
TSPAN4-212ENST00000494815 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.74□□□□□ -1.65
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TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.27□□□□□ -1.73
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TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-8O75690 187 aa4.14□□□□□ -1.75
TSPAN4-212ENST00000494815 MUC5ACP98088 5654 aa4.08□□□□□ -1.76
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TSPAN4-212ENST00000494815 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.05□□□□□ -1.76
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.03□□□□□ -1.76
TSPAN4-212ENST00000494815 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.83□□□□□ -1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 LCE1FQ5T754 118 aa3.8□□□□□ -1.8
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.61□□□□□ -1.83
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.56□□□□□ -1.84
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.28□□□□□ -1.88
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.25□□□□□ -1.89
TSPAN4-212ENST00000494815 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.17□□□□□ -1.9
TSPAN4-212ENST00000494815 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.07□□□□□ -1.92
TSPAN4-212ENST00000494815 PHGR1C9JFL3 82 aa3.05□□□□□ -1.92
TSPAN4-212ENST00000494815 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.97□□□□□ -2.09
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