RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494420.1

HOXB-AS3-215, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 2

Gene HOXB-AS3, Length 431 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-215ENST00000494420 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.74□□□□□ -1.33
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE1DQ5T752 114 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 UQCR11O14957 56 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE4AQ5TA78 99 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 TMEM258P61165 79 aa6.69□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MT4P47944 62 aa6.66□□□□□ -1.34
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP12-3P60328 96 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXB-AS3-215ENST00000494420 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.53□□□□□ -1.36
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.47□□□□□ -1.37
HOXB-AS3-215ENST00000494420 K7ERS5 55 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PSPHP1O15172 72 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 V9GYY9 64 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXB-AS3-215ENST00000494420 Q1T7F1 81 aa6.32□□□□□ -1.4
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.22□□□□□ -1.41
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A6NED7 52 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP12-4P60329 112 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.11□□□□□ -1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.09□□□□□ -1.43
HOXB-AS3-215ENST00000494420 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.08□□□□□ -1.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.01□□□□□ -1.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 ROMO1P60602 79 aa5.99□□□□□ -1.45
HOXB-AS3-215ENST00000494420 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.89□□□□□ -1.47
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MT1AP04731 61 aa5.83□□□□□ -1.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.81□□□□□ -1.48
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PCP4P48539 62 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.67□□□□□ -1.5
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.57□□□□□ -1.52
HOXB-AS3-215ENST00000494420 H3BS24 57 aa5.49□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-8O75690 187 aa5.47□□□□□ -1.53
HOXB-AS3-215ENST00000494420 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.37□□□□□ -1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MT3P25713 68 aa5.36□□□□□ -1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.34□□□□□ -1.55
HOXB-AS3-215ENST00000494420 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MUC5ACP98088 5654 aa5.24□□□□□ -1.57
HOXB-AS3-215ENST00000494420 BRK1Q8WUW1 75 aa5.19□□□□□ -1.58
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.14□□□□□ -1.59
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE1EQ5T753 118 aa4.91□□□□□ -1.62
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PMAIP1Q13794 54 aa4.88□□□□□ -1.63
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRAC1Q96KF2 57 aa4.72□□□□□ -1.65
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.68□□□□□ -1.66
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE1CQ5T751 118 aa4.56□□□□□ -1.68
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.39□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRO0628Q9UI54 55 aa4.36□□□□□ -1.71
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.21□□□□□ -1.74
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.12□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.11□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-215ENST00000494420 SVIPQ8NHG7 77 aa4.11□□□□□ -1.75
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LUZP6Q538Z0 58 aa4.04□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-215ENST00000494420 LCE1FQ5T754 118 aa4.03□□□□□ -1.76
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.81□□□□□ -1.8
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PHGR1C9JFL3 82 aa3.67□□□□□ -1.82
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.55□□□□□ -1.84
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.32□□□□□ -1.88
HOXB-AS3-215ENST00000494420 NDUFAF8A1L188 74 aa3.07□□□□□ -1.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 PRM1P04553 51 aa3.05□□□□□ -1.92
HOXB-AS3-215ENST00000494420 A0A0A0MQY5 61 aa2.93□□□□□ -1.94
HOXB-AS3-215ENST00000494420 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.78□□□□□ -1.96
HOXB-AS3-215ENST00000494420 INE1O15225 51 aa2.42□□□□□ -2.02
HOXB-AS3-215ENST00000494420 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.39□□□□□ -2.03
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