RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493959.6

SENP6-211, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 3

Gene SENP6, Length 867 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-211ENST00000493959 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
SENP6-211ENST00000493959 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.97□□□□□ -1.13
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.96□□□□□ -1.14
SENP6-211ENST00000493959 LCE1DQ5T752 114 aa7.89□□□□□ -1.15
SENP6-211ENST00000493959 MT4P47944 62 aa7.82□□□□□ -1.16
SENP6-211ENST00000493959 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.81□□□□□ -1.16
SENP6-211ENST00000493959 LCE4AQ5TA78 99 aa7.81□□□□□ -1.16
SENP6-211ENST00000493959 UQCR11O14957 56 aa7.76□□□□□ -1.17
SENP6-211ENST00000493959 TMEM258P61165 79 aa7.76□□□□□ -1.17
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.76□□□□□ -1.17
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP12-3P60328 96 aa7.74□□□□□ -1.17
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7.7□□□□□ -1.18
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.69□□□□□ -1.18
SENP6-211ENST00000493959 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.61□□□□□ -1.19
SENP6-211ENST00000493959 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.57□□□□□ -1.2
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.52□□□□□ -1.21
SENP6-211ENST00000493959 PSPHP1O15172 72 aa7.47□□□□□ -1.21
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.45□□□□□ -1.22
SENP6-211ENST00000493959 K7ERS5 55 aa7.4□□□□□ -1.22
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa7.38□□□□□ -1.23
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa7.38□□□□□ -1.23
SENP6-211ENST00000493959 Q1T7F1 81 aa7.36□□□□□ -1.23
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP6-211ENST00000493959 V9GYY9 64 aa7.35□□□□□ -1.23
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.28□□□□□ -1.24
SENP6-211ENST00000493959 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.21□□□□□ -1.26
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.2□□□□□ -1.26
SENP6-211ENST00000493959 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.18□□□□□ -1.26
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP12-4P60329 112 aa7.16□□□□□ -1.26
SENP6-211ENST00000493959 A6NED7 52 aa7.14□□□□□ -1.27
SENP6-211ENST00000493959 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.13□□□□□ -1.27
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.05□□□□□ -1.28
SENP6-211ENST00000493959 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.03□□□□□ -1.28
SENP6-211ENST00000493959 ROMO1P60602 79 aa6.95□□□□□ -1.3
SENP6-211ENST00000493959 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.86□□□□□ -1.31
SENP6-211ENST00000493959 MT1AP04731 61 aa6.84□□□□□ -1.31
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.8□□□□□ -1.32
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.73□□□□□ -1.33
SENP6-211ENST00000493959 PCP4P48539 62 aa6.68□□□□□ -1.34
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.66□□□□□ -1.34
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.63□□□□□ -1.35
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.56□□□□□ -1.36
SENP6-211ENST00000493959 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.46□□□□□ -1.38
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-8O75690 187 aa6.45□□□□□ -1.38
SENP6-211ENST00000493959 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
SENP6-211ENST00000493959 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
SENP6-211ENST00000493959 MT3P25713 68 aa6.24□□□□□ -1.41
SENP6-211ENST00000493959 MUC5ACP98088 5654 aa6.18□□□□□ -1.42
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.06□□□□□ -1.44
SENP6-211ENST00000493959 BRK1Q8WUW1 75 aa6.01□□□□□ -1.45
SENP6-211ENST00000493959 LCE1EQ5T753 118 aa5.73□□□□□ -1.49
SENP6-211ENST00000493959 PMAIP1Q13794 54 aa5.64□□□□□ -1.51
SENP6-211ENST00000493959 PRAC1Q96KF2 57 aa5.56□□□□□ -1.52
SENP6-211ENST00000493959 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.48□□□□□ -1.53
SENP6-211ENST00000493959 LCE1CQ5T751 118 aa5.33□□□□□ -1.56
SENP6-211ENST00000493959 SVIPQ8NHG7 77 aa5.26□□□□□ -1.57
SENP6-211ENST00000493959 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.11□□□□□ -1.59
SENP6-211ENST00000493959 PRO0628Q9UI54 55 aa5.04□□□□□ -1.6
SENP6-211ENST00000493959 A0A0A0MQY5 61 aa5□□□□□ -1.61
SENP6-211ENST00000493959 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.86□□□□□ -1.63
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.82□□□□□ -1.64
SENP6-211ENST00000493959 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.79□□□□□ -1.64
SENP6-211ENST00000493959 LCE1FQ5T754 118 aa4.68□□□□□ -1.66
SENP6-211ENST00000493959 LUZP6Q538Z0 58 aa4.58□□□□□ -1.68
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.51□□□□□ -1.69
SENP6-211ENST00000493959 PHGR1C9JFL3 82 aa4.27□□□□□ -1.73
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.21□□□□□ -1.74
SENP6-211ENST00000493959 NDUFAF8A1L188 74 aa4.16□□□□□ -1.74
SENP6-211ENST00000493959 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.98□□□□□ -1.77
SENP6-211ENST00000493959 PRM1P04553 51 aa3.59□□□□□ -1.83
SENP6-211ENST00000493959 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.2□□□□□ -1.9
SENP6-211ENST00000493959 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.78□□□□□ -1.96
SENP6-211ENST00000493959 INE1O15225 51 aa2.72□□□□□ -1.97
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.6 ms