RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493618.5

ATG4B-223, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, human

TSL 5

Gene ATG4B, Length 899 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATG4B-223	ENST00000493618	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.09	□□□□□ -1.6
ATG4B-223	ENST00000493618	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG4B-223	ENST00000493618	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4B-223	ENST00000493618	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5	□□□□□ -1.61
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ATG4B-223	ENST00000493618	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ATG4B-223	ENST00000493618	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG4B-223	ENST00000493618	UQCR11	O14957	56 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG4B-223	ENST00000493618	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
ATG4B-223	ENST00000493618	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.78	□□□□□ -1.64
ATG4B-223	ENST00000493618	TMEM258	P61165	79 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.77	□□□□□ -1.65
ATG4B-223	ENST00000493618	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.75	□□□□□ -1.65
ATG4B-223	ENST00000493618	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.74	□□□□□ -1.65
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.67	□□□□□ -1.66
ATG4B-223	ENST00000493618		K7ERS5	55 aa		4.65	□□□□□ -1.67
ATG4B-223	ENST00000493618	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
ATG4B-223	ENST00000493618	PSPHP1	O15172	72 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATG4B-223	ENST00000493618	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.55	□□□□□ -1.68
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4B-223	ENST00000493618		V9GYY9	64 aa		4.52	□□□□□ -1.69
ATG4B-223	ENST00000493618		Q1T7F1	81 aa		4.5	□□□□□ -1.69
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ATG4B-223	ENST00000493618		A6NED7	52 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ATG4B-223	ENST00000493618	MT1A	P04731	61 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ATG4B-223	ENST00000493618	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ATG4B-223	ENST00000493618	ROMO1	P60602	79 aa		4.33	□□□□□ -1.72
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.32	□□□□□ -1.72
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.29	□□□□□ -1.72
ATG4B-223	ENST00000493618	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.28	□□□□□ -1.72
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.28	□□□□□ -1.72
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.25	□□□□□ -1.73
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.24	□□□□□ -1.73
ATG4B-223	ENST00000493618	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.2	□□□□□ -1.74
ATG4B-223	ENST00000493618	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.18	□□□□□ -1.74
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4B-223	ENST00000493618	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.1	□□□□□ -1.75
ATG4B-223	ENST00000493618	MT3	P25713	68 aa		4.03	□□□□□ -1.76
ATG4B-223	ENST00000493618	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.95	□□□□□ -1.78
ATG4B-223	ENST00000493618	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.8	□□□□□ -1.8
ATG4B-223	ENST00000493618	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.76	□□□□□ -1.81
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.69	□□□□□ -1.82
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.58	□□□□□ -1.84
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.55	□□□□□ -1.84
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ATG4B-223	ENST00000493618		H3BS24	57 aa		3.37	□□□□□ -1.87
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.32	□□□□□ -1.88
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.25	□□□□□ -1.89
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ATG4B-223	ENST00000493618		A0A0A0MQY5	61 aa		3.11	□□□□□ -1.91
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
ATG4B-223	ENST00000493618	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.03	□□□□□ -1.92
ATG4B-223	ENST00000493618	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.99	□□□□□ -1.93
ATG4B-223	ENST00000493618	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.98	□□□□□ -1.93
ATG4B-223	ENST00000493618	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.97	□□□□□ -1.93
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.9	□□□□□ -1.95
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.74	□□□□□ -1.97
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.58	□□□□□ -2
ATG4B-223	ENST00000493618	INE1	O15225	51 aa		2.48	□□□□□ -2.01
ATG4B-223	ENST00000493618	PRM1	P04553	51 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ATG4B-223	ENST00000493618	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.24	□□□□□ -2.05
ATG4B-223	ENST00000493618	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.84	□□□□□ -2.11

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