RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.73□□□□□ -1.49
TOM1-216ENST00000492723 INE1O15225 51 aa5.72□□□□□ -1.49
TOM1-216ENST00000492723 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.65□□□□□ -1.5
TOM1-216ENST00000492723 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.65□□□□□ -1.51
TOM1-216ENST00000492723 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.64□□□□□ -1.51
TOM1-216ENST00000492723 MT1GP13640 62 aa5.61□□□□□ -1.51
TOM1-216ENST00000492723 MT1MQ8N339 61 aa5.6□□□□□ -1.51
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.59□□□□□ -1.51
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.55□□□□□ -1.52
TOM1-216ENST00000492723 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.51□□□□□ -1.53
TOM1-216ENST00000492723 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TOM1-216ENST00000492723 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.48□□□□□ -1.53
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.4□□□□□ -1.54
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.4□□□□□ -1.54
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.4□□□□□ -1.54
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-9P26371 169 aa5.39□□□□□ -1.55
TOM1-216ENST00000492723 MDN1Q9NU22 5596 aa5.39□□□□□ -1.55
TOM1-216ENST00000492723 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
TOM1-216ENST00000492723 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.32□□□□□ -1.56
TOM1-216ENST00000492723 SPRR2EP22531 72 aa5.26□□□□□ -1.57
TOM1-216ENST00000492723 SPRR2BP35325 72 aa5.26□□□□□ -1.57
TOM1-216ENST00000492723 SPRR2AP35326 72 aa5.26□□□□□ -1.57
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.23□□□□□ -1.57
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.13□□□□□ -1.59
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.05□□□□□ -1.6
TOM1-216ENST00000492723 SPRR2DP22532 72 aa5.05□□□□□ -1.6
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.99□□□□□ -1.61
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
TOM1-216ENST00000492723 MT1AP04731 61 aa4.97□□□□□ -1.61
TOM1-216ENST00000492723 LCE3BQ5TA77 95 aa4.97□□□□□ -1.61
TOM1-216ENST00000492723 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.78□□□□□ -1.64
TOM1-216ENST00000492723 NEBP20929 6669 aa4.77□□□□□ -1.65
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.71□□□□□ -1.66
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP12-4P60329 112 aa4.7□□□□□ -1.66
TOM1-216ENST00000492723 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.59□□□□□ -1.68
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.58□□□□□ -1.68
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.55□□□□□ -1.68
TOM1-216ENST00000492723 MT3P25713 68 aa4.5□□□□□ -1.69
TOM1-216ENST00000492723 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.48□□□□□ -1.69
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.45□□□□□ -1.7
TOM1-216ENST00000492723 MT4P47944 62 aa4.43□□□□□ -1.7
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.42□□□□□ -1.7
TOM1-216ENST00000492723 LCE4AQ5TA78 99 aa4.4□□□□□ -1.7
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.36□□□□□ -1.71
TOM1-216ENST00000492723 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.31□□□□□ -1.72
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.31□□□□□ -1.72
TOM1-216ENST00000492723 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.28□□□□□ -1.72
TOM1-216ENST00000492723 LCE1DQ5T752 114 aa4.25□□□□□ -1.73
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.21□□□□□ -1.74
TOM1-216ENST00000492723 PRM1P04553 51 aa4.15□□□□□ -1.75
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.11□□□□□ -1.75
TOM1-216ENST00000492723 LCE1EQ5T753 118 aa3.78□□□□□ -1.8
TOM1-216ENST00000492723 MUC5ACP98088 5654 aa3.72□□□□□ -1.81
TOM1-216ENST00000492723 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.68□□□□□ -1.82
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.65□□□□□ -1.82
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.62□□□□□ -1.83
TOM1-216ENST00000492723 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.61□□□□□ -1.83
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.57□□□□□ -1.84
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.56□□□□□ -1.84
TOM1-216ENST00000492723 LCE1CQ5T751 118 aa3.55□□□□□ -1.84
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-8O75690 187 aa3.5□□□□□ -1.85
TOM1-216ENST00000492723 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.5□□□□□ -1.85
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.4□□□□□ -1.87
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.24□□□□□ -1.89
TOM1-216ENST00000492723 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.09□□□□□ -1.91
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.07□□□□□ -1.92
TOM1-216ENST00000492723 LCE1FQ5T754 118 aa3.06□□□□□ -1.92
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.96□□□□□ -1.94
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.95□□□□□ -1.94
TOM1-216ENST00000492723 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
TOM1-216ENST00000492723 PHGR1C9JFL3 82 aa2.66□□□□□ -1.98
TOM1-216ENST00000492723 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.61□□□□□ -1.99
TOM1-216ENST00000492723 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.6□□□□□ -1.99
TOM1-216ENST00000492723 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.73□□□□□ -2.13
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