RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492485.5

TRIOBP-211, Transcript of TRIO and F-actin binding protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TRIOBP, Length 3,948 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.28□□□□□ -1.72
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.28□□□□□ -1.72
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP12-4P60329 112 aa4.24□□□□□ -1.73
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.18□□□□□ -1.74
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.09□□□□□ -1.76
TRIOBP-211ENST00000492485 SSPOA2VEC9 5147 aa4.07□□□□□ -1.76
TRIOBP-211ENST00000492485 MT1LQ93083 61 aa4.07□□□□□ -1.76
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.04□□□□□ -1.76
TRIOBP-211ENST00000492485 MT1EP04732 61 aa4.02□□□□□ -1.77
TRIOBP-211ENST00000492485 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.96□□□□□ -1.78
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.85□□□□□ -1.79
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.83□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 MT1MQ8N339 61 aa3.83□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRR2EP22531 72 aa3.8□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRR2BP35325 72 aa3.8□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRR2AP35326 72 aa3.8□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.79□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.79□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.79□□□□□ -1.8
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.77□□□□□ -1.81
TRIOBP-211ENST00000492485 PRM1P04553 51 aa3.76□□□□□ -1.81
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.73□□□□□ -1.81
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.72□□□□□ -1.81
TRIOBP-211ENST00000492485 MDN1Q9NU22 5596 aa3.68□□□□□ -1.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.66□□□□□ -1.82
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIOBP-211ENST00000492485 SPRR2DP22532 72 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.64□□□□□ -1.83
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.59□□□□□ -1.83
TRIOBP-211ENST00000492485 MT4P47944 62 aa3.47□□□□□ -1.85
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.4□□□□□ -1.86
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.4□□□□□ -1.87
TRIOBP-211ENST00000492485 MT1AP04731 61 aa3.37□□□□□ -1.87
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE1DQ5T752 114 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.33□□□□□ -1.88
TRIOBP-211ENST00000492485 MT3P25713 68 aa3.31□□□□□ -1.88
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.29□□□□□ -1.88
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.25□□□□□ -1.89
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.12□□□□□ -1.91
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.12□□□□□ -1.91
TRIOBP-211ENST00000492485 NEBP20929 6669 aa3.11□□□□□ -1.91
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC5ACP98088 5654 aa3.03□□□□□ -1.92
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.02□□□□□ -1.93
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-9P26371 169 aa3.02□□□□□ -1.93
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.99□□□□□ -1.93
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.94□□□□□ -1.94
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE1EQ5T753 118 aa2.9□□□□□ -1.94
TRIOBP-211ENST00000492485 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.9□□□□□ -1.95
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE4AQ5TA78 99 aa2.81□□□□□ -1.96
TRIOBP-211ENST00000492485 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.79□□□□□ -1.96
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.75□□□□□ -1.97
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.66□□□□□ -1.98
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.57□□□□□ -2
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.57□□□□□ -2
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE1FQ5T754 118 aa2.55□□□□□ -2
TRIOBP-211ENST00000492485 LCE1CQ5T751 118 aa2.52□□□□□ -2.01
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.47□□□□□ -2.01
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.44□□□□□ -2.02
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.36□□□□□ -2.03
TRIOBP-211ENST00000492485 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.36□□□□□ -2.03
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.33□□□□□ -2.04
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.33□□□□□ -2.04
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.27□□□□□ -2.05
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-8O75690 187 aa2.17□□□□□ -2.06
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.08□□□□□ -2.08
TRIOBP-211ENST00000492485 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2□□□□□ -2.09
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.97□□□□□ -2.09
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.91□□□□□ -2.1
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.8□□□□□ -2.12
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.78□□□□□ -2.12
TRIOBP-211ENST00000492485 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.74□□□□□ -2.13
TRIOBP-211ENST00000492485 PHGR1C9JFL3 82 aa1.63□□□□□ -2.15
TRIOBP-211ENST00000492485 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.06□□□□□ -2.24
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