RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491269.1

C3orf18-211, Transcript of chromosome 3 open reading frame 18, humanhuman

TSL 4

Gene C3orf18, Length 531 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.42□□□□□ -1.22
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.38□□□□□ -1.23
C3orf18-211ENST00000491269 PSPHP1O15172 72 aa7.37□□□□□ -1.23
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP12-3P60328 96 aa7.3□□□□□ -1.24
C3orf18-211ENST00000491269 V9GYY9 64 aa7.28□□□□□ -1.24
C3orf18-211ENST00000491269 Q1T7F1 81 aa7.26□□□□□ -1.25
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.24□□□□□ -1.25
C3orf18-211ENST00000491269 K7ERS5 55 aa7.23□□□□□ -1.25
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.2□□□□□ -1.26
C3orf18-211ENST00000491269 LCE1DQ5T752 114 aa7.2□□□□□ -1.26
C3orf18-211ENST00000491269 MT4P47944 62 aa7.17□□□□□ -1.26
C3orf18-211ENST00000491269 LCE4AQ5TA78 99 aa7.16□□□□□ -1.26
C3orf18-211ENST00000491269 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.13□□□□□ -1.27
C3orf18-211ENST00000491269 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.1□□□□□ -1.27
C3orf18-211ENST00000491269 A6NED7 52 aa7.08□□□□□ -1.28
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.05□□□□□ -1.28
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.96□□□□□ -1.3
C3orf18-211ENST00000491269 PCP4P48539 62 aa6.89□□□□□ -1.31
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.88□□□□□ -1.31
C3orf18-211ENST00000491269 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
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C3orf18-211ENST00000491269 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.85□□□□□ -1.31
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C3orf18-211ENST00000491269 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.84□□□□□ -1.32
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
C3orf18-211ENST00000491269 ROMO1P60602 79 aa6.79□□□□□ -1.32
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.75□□□□□ -1.33
C3orf18-211ENST00000491269 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.73□□□□□ -1.33
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C3orf18-211ENST00000491269 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP12-4P60329 112 aa6.62□□□□□ -1.35
C3orf18-211ENST00000491269 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.6□□□□□ -1.35
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C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.39□□□□□ -1.39
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.39□□□□□ -1.39
C3orf18-211ENST00000491269 MT1AP04731 61 aa6.38□□□□□ -1.39
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.34□□□□□ -1.39
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.19□□□□□ -1.42
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.17□□□□□ -1.42
C3orf18-211ENST00000491269 BRK1Q8WUW1 75 aa6.13□□□□□ -1.43
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.08□□□□□ -1.44
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.07□□□□□ -1.44
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-8O75690 187 aa5.87□□□□□ -1.47
C3orf18-211ENST00000491269 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.83□□□□□ -1.48
C3orf18-211ENST00000491269 MT3P25713 68 aa5.82□□□□□ -1.48
C3orf18-211ENST00000491269 PMAIP1Q13794 54 aa5.73□□□□□ -1.49
C3orf18-211ENST00000491269 PRAC1Q96KF2 57 aa5.61□□□□□ -1.51
C3orf18-211ENST00000491269 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
C3orf18-211ENST00000491269 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.56□□□□□ -1.52
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.55□□□□□ -1.52
C3orf18-211ENST00000491269 MUC5ACP98088 5654 aa5.54□□□□□ -1.52
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C3orf18-211ENST00000491269 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.09□□□□□ -1.59
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.06□□□□□ -1.6
C3orf18-211ENST00000491269 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.05□□□□□ -1.6
C3orf18-211ENST00000491269 LCE1CQ5T751 118 aa4.92□□□□□ -1.62
C3orf18-211ENST00000491269 SVIPQ8NHG7 77 aa4.92□□□□□ -1.62
C3orf18-211ENST00000491269 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.86□□□□□ -1.63
C3orf18-211ENST00000491269 LUZP6Q538Z0 58 aa4.63□□□□□ -1.67
C3orf18-211ENST00000491269 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.58□□□□□ -1.68
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.45□□□□□ -1.7
C3orf18-211ENST00000491269 LCE1FQ5T754 118 aa4.28□□□□□ -1.72
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.18□□□□□ -1.74
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.91□□□□□ -1.78
C3orf18-211ENST00000491269 PHGR1C9JFL3 82 aa3.88□□□□□ -1.79
C3orf18-211ENST00000491269 NDUFAF8A1L188 74 aa3.75□□□□□ -1.81
C3orf18-211ENST00000491269 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.6□□□□□ -1.83
C3orf18-211ENST00000491269 H3BS24 57 aa3.57□□□□□ -1.84
C3orf18-211ENST00000491269 PRM1P04553 51 aa3.51□□□□□ -1.85
C3orf18-211ENST00000491269 A0A0A0MQY5 61 aa3.12□□□□□ -1.91
C3orf18-211ENST00000491269 INE1O15225 51 aa2.91□□□□□ -1.94
C3orf18-211ENST00000491269 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.9□□□□□ -1.95
C3orf18-211ENST00000491269 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 139.8 ms