RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-212ENST00000491266 A0A0D9SG42 100 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP12-1P59990 96 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-212ENST00000491266 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.6□□□□□ -1.99
RABGGTB-212ENST00000491266 UQCR11O14957 56 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 MT1XP80297 61 aa2.57□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 A6NN06 94 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.56□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 A6NED7 52 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.53□□□□□ -2
RABGGTB-212ENST00000491266 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-212ENST00000491266 PRO0628Q9UI54 55 aa2.52□□□□□ -2.01
RABGGTB-212ENST00000491266 PLAC4Q8WY50 150 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-212ENST00000491266 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.5□□□□□ -2.01
RABGGTB-212ENST00000491266 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.49□□□□□ -2.01
RABGGTB-212ENST00000491266 PMAIP1Q13794 54 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-212ENST00000491266 BRK1Q8WUW1 75 aa2.44□□□□□ -2.02
RABGGTB-212ENST00000491266 PP632Q6XCG6 107 aa2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.39□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 KMT2DO14686 5537 aa2.35□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 K7ERS5 55 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 ROMO1P60602 79 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 LUZP6Q538Z0 58 aa2.34□□□□□ -2.03
RABGGTB-212ENST00000491266 LCE1CQ5T751 118 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-212ENST00000491266 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.32□□□□□ -2.04
RABGGTB-212ENST00000491266 TNP1P09430 55 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.31□□□□□ -2.04
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.3□□□□□ -2.04
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.29□□□□□ -2.04
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.27□□□□□ -2.05
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP5-8O75690 187 aa2.26□□□□□ -2.05
RABGGTB-212ENST00000491266 MT1EP04732 61 aa2.25□□□□□ -2.05
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.24□□□□□ -2.05
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.22□□□□□ -2.05
RABGGTB-212ENST00000491266 NEBP20929 6669 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP12-3P60328 96 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-212ENST00000491266 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.21□□□□□ -2.06
RABGGTB-212ENST00000491266 MT1LQ93083 61 aa2.2□□□□□ -2.06
RABGGTB-212ENST00000491266 MDN1Q9NU22 5596 aa2.19□□□□□ -2.06
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.15□□□□□ -2.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRR2EP22531 72 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRR2BP35325 72 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRR2AP35326 72 aa2.14□□□□□ -2.07
RABGGTB-212ENST00000491266 MT1MQ8N339 61 aa2.12□□□□□ -2.07
RABGGTB-212ENST00000491266 MT1GP13640 62 aa2.1□□□□□ -2.07
RABGGTB-212ENST00000491266 SPRR2DP22532 72 aa2.05□□□□□ -2.08
RABGGTB-212ENST00000491266 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.02□□□□□ -2.09
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.97□□□□□ -2.09
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.96□□□□□ -2.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP12-4P60329 112 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.92□□□□□ -2.1
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-212ENST00000491266 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.86□□□□□ -2.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.85□□□□□ -2.11
RABGGTB-212ENST00000491266 MT1AP04731 61 aa1.84□□□□□ -2.11
RABGGTB-212ENST00000491266 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.81□□□□□ -2.12
RABGGTB-212ENST00000491266 MT4P47944 62 aa1.8□□□□□ -2.12
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.76□□□□□ -2.13
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.72□□□□□ -2.13
RABGGTB-212ENST00000491266 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.7□□□□□ -2.14
RABGGTB-212ENST00000491266 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-212ENST00000491266 INE1O15225 51 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC5ACP98088 5654 aa1.46□□□□□ -2.18
RABGGTB-212ENST00000491266 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.35□□□□□ -2.19
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.34□□□□□ -2.19
RABGGTB-212ENST00000491266 PRM1P04553 51 aa1.24□□□□□ -2.21
RABGGTB-212ENST00000491266 PHGR1C9JFL3 82 aa1.06□□□□□ -2.24
RABGGTB-212ENST00000491266 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.9□□□□□ -2.27
RABGGTB-212ENST00000491266 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.76□□□□□ -2.29
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