RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0D9SG42	100 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP12-1	P59990	96 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.6	□□□□□ -1.99
RABGGTB-212	ENST00000491266	UQCR11	O14957	56 aa		2.57	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1X	P80297	61 aa		2.57	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NN06	94 aa		2.56	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		2.56	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		2.56	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	2.54	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266		A6NED7	52 aa		2.53	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.53	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		2.53	□□□□□ -2
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRO0628	Q9UI54	55 aa		2.52	□□□□□ -2.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLAC4	Q8WY50	150 aa		2.5	□□□□□ -2.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.5	□□□□□ -2.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		2.49	□□□□□ -2.01
RABGGTB-212	ENST00000491266	PMAIP1	Q13794	54 aa		2.44	□□□□□ -2.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	BRK1	Q8WUW1	75 aa		2.44	□□□□□ -2.02
RABGGTB-212	ENST00000491266	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.4	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	2.4	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		2.39	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	2.36	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	KMT2D	O14686	5537 aa		2.35	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266		K7ERS5	55 aa		2.34	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	ROMO1	P60602	79 aa		2.34	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.34	□□□□□ -2.03
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.32	□□□□□ -2.04
RABGGTB-212	ENST00000491266	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.32	□□□□□ -2.04
RABGGTB-212	ENST00000491266	TNP1	P09430	55 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		2.31	□□□□□ -2.04
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		2.3	□□□□□ -2.04
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		2.29	□□□□□ -2.04
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		2.27	□□□□□ -2.05
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		2.27	□□□□□ -2.05
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1E	P04732	61 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		2.24	□□□□□ -2.05
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		2.22	□□□□□ -2.05
RABGGTB-212	ENST00000491266	NEB	P20929	6669 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP12-3	P60328	96 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RABGGTB-212	ENST00000491266	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.21	□□□□□ -2.06
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1L	Q93083	61 aa		2.2	□□□□□ -2.06
RABGGTB-212	ENST00000491266	MDN1	Q9NU22	5596 aa		2.19	□□□□□ -2.06
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		2.15	□□□□□ -2.07
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR2E	P22531	72 aa		2.14	□□□□□ -2.07
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR2B	P35325	72 aa		2.14	□□□□□ -2.07
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR2A	P35326	72 aa		2.14	□□□□□ -2.07
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1M	Q8N339	61 aa		2.12	□□□□□ -2.07
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1G	P13640	62 aa		2.1	□□□□□ -2.07
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPRR2D	P22532	72 aa		2.05	□□□□□ -2.08
RABGGTB-212	ENST00000491266	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	2.02	□□□□□ -2.09
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		1.97	□□□□□ -2.09
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		1.97	□□□□□ -2.09
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		1.96	□□□□□ -2.1
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.96	□□□□□ -2.1
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP12-4	P60329	112 aa		1.92	□□□□□ -2.1
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		1.92	□□□□□ -2.1
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		1.86	□□□□□ -2.11
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	1.86	□□□□□ -2.11
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.85	□□□□□ -2.11
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT1A	P04731	61 aa		1.84	□□□□□ -2.11
RABGGTB-212	ENST00000491266	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		1.81	□□□□□ -2.12
RABGGTB-212	ENST00000491266	MT4	P47944	62 aa		1.8	□□□□□ -2.12
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		1.76	□□□□□ -2.13
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		1.72	□□□□□ -2.13
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		1.7	□□□□□ -2.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		1.66	□□□□□ -2.14
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.64	□□□□□ -2.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	INE1	O15225	51 aa		1.62	□□□□□ -2.15
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		1.58	□□□□□ -2.16
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC5AC	P98088	5654 aa		1.46	□□□□□ -2.18
RABGGTB-212	ENST00000491266	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.35	□□□□□ -2.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	1.34	□□□□□ -2.19
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRM1	P04553	51 aa		1.24	□□□□□ -2.21
RABGGTB-212	ENST00000491266	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.06	□□□□□ -2.24
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.9	□□□□□ -2.27
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		0.76	□□□□□ -2.29

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