RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 MT1MQ8N339 61 aa4.26□□□□□ -1.73
NISCH-214ENST00000490425 PP632Q6XCG6 107 aa4.25□□□□□ -1.73
NISCH-214ENST00000490425 V9GYY9 64 aa4.24□□□□□ -1.73
NISCH-214ENST00000490425 Q1T7F1 81 aa4.22□□□□□ -1.73
NISCH-214ENST00000490425 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.19□□□□□ -1.74
NISCH-214ENST00000490425 K7ERS5 55 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP12-3P60328 96 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.14□□□□□ -1.75
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.11□□□□□ -1.75
NISCH-214ENST00000490425 A6NED7 52 aa4.1□□□□□ -1.75
NISCH-214ENST00000490425 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.1□□□□□ -1.75
NISCH-214ENST00000490425 LCE1DQ5T752 114 aa4.07□□□□□ -1.76
NISCH-214ENST00000490425 MT4P47944 62 aa4.05□□□□□ -1.76
NISCH-214ENST00000490425 PCP4P48539 62 aa4.05□□□□□ -1.76
NISCH-214ENST00000490425 LCE4AQ5TA78 99 aa4.05□□□□□ -1.76
NISCH-214ENST00000490425 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4□□□□□ -1.77
NISCH-214ENST00000490425 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.97□□□□□ -1.77
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.96□□□□□ -1.78
NISCH-214ENST00000490425 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.93□□□□□ -1.78
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.93□□□□□ -1.78
NISCH-214ENST00000490425 ROMO1P60602 79 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-214ENST00000490425 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.89□□□□□ -1.79
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
NISCH-214ENST00000490425 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.87□□□□□ -1.79
NISCH-214ENST00000490425 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.85□□□□□ -1.79
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.83□□□□□ -1.8
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.79□□□□□ -1.8
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP12-4P60329 112 aa3.76□□□□□ -1.81
NISCH-214ENST00000490425 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.75□□□□□ -1.81
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.72□□□□□ -1.81
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.7□□□□□ -1.82
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.66□□□□□ -1.82
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.64□□□□□ -1.83
NISCH-214ENST00000490425 MT1AP04731 61 aa3.63□□□□□ -1.83
NISCH-214ENST00000490425 BRK1Q8WUW1 75 aa3.58□□□□□ -1.84
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.52□□□□□ -1.85
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.5□□□□□ -1.85
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.46□□□□□ -1.86
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.43□□□□□ -1.86
NISCH-214ENST00000490425 PMAIP1Q13794 54 aa3.36□□□□□ -1.87
NISCH-214ENST00000490425 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.35□□□□□ -1.87
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-8O75690 187 aa3.32□□□□□ -1.88
NISCH-214ENST00000490425 MT3P25713 68 aa3.31□□□□□ -1.88
NISCH-214ENST00000490425 PRO0628Q9UI54 55 aa3.29□□□□□ -1.88
NISCH-214ENST00000490425 PRAC1Q96KF2 57 aa3.27□□□□□ -1.89
NISCH-214ENST00000490425 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.24□□□□□ -1.89
NISCH-214ENST00000490425 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
NISCH-214ENST00000490425 MUC5ACP98088 5654 aa3.21□□□□□ -1.9
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.16□□□□□ -1.9
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.14□□□□□ -1.91
NISCH-214ENST00000490425 H3BS24 57 aa3.05□□□□□ -1.92
NISCH-214ENST00000490425 LCE1EQ5T753 118 aa3.01□□□□□ -1.93
NISCH-214ENST00000490425 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.99□□□□□ -1.93
NISCH-214ENST00000490425 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.88□□□□□ -1.95
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.87□□□□□ -1.95
NISCH-214ENST00000490425 A0A0A0MQY5 61 aa2.83□□□□□ -1.96
NISCH-214ENST00000490425 LCE1CQ5T751 118 aa2.8□□□□□ -1.96
NISCH-214ENST00000490425 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.78□□□□□ -1.96
NISCH-214ENST00000490425 LUZP6Q538Z0 58 aa2.69□□□□□ -1.98
NISCH-214ENST00000490425 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.62□□□□□ -1.99
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.62□□□□□ -1.99
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.53□□□□□ -2
NISCH-214ENST00000490425 NDUFAF8A1L188 74 aa2.43□□□□□ -2.02
NISCH-214ENST00000490425 LCE1FQ5T754 118 aa2.43□□□□□ -2.02
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.39□□□□□ -2.03
NISCH-214ENST00000490425 PHGR1C9JFL3 82 aa2.25□□□□□ -2.05
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.22□□□□□ -2.05
NISCH-214ENST00000490425 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.1□□□□□ -2.07
NISCH-214ENST00000490425 INE1O15225 51 aa2.05□□□□□ -2.08
NISCH-214ENST00000490425 PRM1P04553 51 aa2.03□□□□□ -2.08
NISCH-214ENST00000490425 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.73□□□□□ -2.13
NISCH-214ENST00000490425 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.52□□□□□ -2.17
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