RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489571.5

PGAP2-223, Transcript of post-GPI attachment to proteins 2, human

TSL 2

Gene PGAP2, Length 879 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.54	□□□□□ -1.52
PGAP2-223	ENST00000489571	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.49	□□□□□ -1.53
PGAP2-223	ENST00000489571	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PGAP2-223	ENST00000489571	MT4	P47944	62 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PGAP2-223	ENST00000489571	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
PGAP2-223	ENST00000489571	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PGAP2-223	ENST00000489571	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP12-3	P60328	96 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PGAP2-223	ENST00000489571	UQCR11	O14957	56 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PGAP2-223	ENST00000489571	TMEM258	P61165	79 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.2	□□□□□ -1.58
PGAP2-223	ENST00000489571	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PGAP2-223	ENST00000489571	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PGAP2-223	ENST00000489571		K7ERS5	55 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PGAP2-223	ENST00000489571	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PGAP2-223	ENST00000489571	PSPHP1	O15172	72 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		5	□□□□□ -1.61
PGAP2-223	ENST00000489571		V9GYY9	64 aa		5	□□□□□ -1.61
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PGAP2-223	ENST00000489571		Q1T7F1	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PGAP2-223	ENST00000489571		A6NED7	52 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PGAP2-223	ENST00000489571	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PGAP2-223	ENST00000489571	MT1A	P04731	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.74	□□□□□ -1.65
PGAP2-223	ENST00000489571	ROMO1	P60602	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
PGAP2-223	ENST00000489571	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-8	O75690	187 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGAP2-223	ENST00000489571	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.55	□□□□□ -1.68
PGAP2-223	ENST00000489571	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
PGAP2-223	ENST00000489571	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
PGAP2-223	ENST00000489571	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.43	□□□□□ -1.7
PGAP2-223	ENST00000489571	MT3	P25713	68 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PGAP2-223	ENST00000489571	PCP4	P48539	62 aa		4.35	□□□□□ -1.71
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.26	□□□□□ -1.73
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PGAP2-223	ENST00000489571	SVIP	Q8NHG7	77 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PGAP2-223	ENST00000489571	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.98	□□□□□ -1.77
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.81	□□□□□ -1.8
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PGAP2-223	ENST00000489571	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.73	□□□□□ -1.81
PGAP2-223	ENST00000489571	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.66	□□□□□ -1.82
PGAP2-223	ENST00000489571		A0A0A0MQY5	61 aa		3.65	□□□□□ -1.83
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.42	□□□□□ -1.86
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.41	□□□□□ -1.86
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PGAP2-223	ENST00000489571	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PGAP2-223	ENST00000489571	PRO0628	Q9UI54	55 aa		3.3	□□□□□ -1.88
PGAP2-223	ENST00000489571	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.21	□□□□□ -1.9
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.14	□□□□□ -1.91
PGAP2-223	ENST00000489571	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.1	□□□□□ -1.91
PGAP2-223	ENST00000489571	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PGAP2-223	ENST00000489571	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.89	□□□□□ -1.95
PGAP2-223	ENST00000489571	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.84	□□□□□ -1.96
PGAP2-223	ENST00000489571	PRM1	P04553	51 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PGAP2-223	ENST00000489571	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.31	□□□□□ -2.04
PGAP2-223	ENST00000489571	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.97	□□□□□ -2.09
PGAP2-223	ENST00000489571	INE1	O15225	51 aa		1.89	□□□□□ -2.11

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 110.5 ms