RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPRR2B	P35325	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPRR2A	P35326	72 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TBC1D23-208	ENST00000486274	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TBC1D23-208	ENST00000486274	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TBC1D23-208	ENST00000486274	SSPO	A2VEC9	5147 aa		3.59	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	MT1E	P04732	61 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	MT1L	Q93083	61 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPRR2D	P22532	72 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TBC1D23-208	ENST00000486274	MT1M	Q8N339	61 aa		3.44	□□□□□ -1.86
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		3.37	□□□□□ -1.87
TBC1D23-208	ENST00000486274	MT4	P47944	62 aa		3.34	□□□□□ -1.88
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.3	□□□□□ -1.88
TBC1D23-208	ENST00000486274	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.28	□□□□□ -1.88
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.23	□□□□□ -1.89
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.21	□□□□□ -1.9
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.17	□□□□□ -1.9
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.13	□□□□□ -1.91
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.1	□□□□□ -1.91
TBC1D23-208	ENST00000486274	MT3	P25713	68 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TBC1D23-208	ENST00000486274	MT1A	P04731	61 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.02	□□□□□ -1.93
TBC1D23-208	ENST00000486274	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3	□□□□□ -1.93
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TBC1D23-208	ENST00000486274	NEB	P20929	6669 aa		2.98	□□□□□ -1.93
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRM1	P04553	51 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		2.93	□□□□□ -1.94
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		2.83	□□□□□ -1.96
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-9	P26371	169 aa		2.83	□□□□□ -1.96
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE4A	Q5TA78	99 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TBC1D23-208	ENST00000486274	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.68	□□□□□ -1.98
TBC1D23-208	ENST00000486274	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.63	□□□□□ -1.99
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.62	□□□□□ -1.99
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.56	□□□□□ -2
TBC1D23-208	ENST00000486274	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.54	□□□□□ -2
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.4	□□□□□ -2.03
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.4	□□□□□ -2.03
TBC1D23-208	ENST00000486274	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.4	□□□□□ -2.03
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.34	□□□□□ -2.03
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.31	□□□□□ -2.04
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.28	□□□□□ -2.04
TBC1D23-208	ENST00000486274	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.27	□□□□□ -2.05
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.26	□□□□□ -2.05
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TBC1D23-208	ENST00000486274	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.14	□□□□□ -2.07
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.07	□□□□□ -2.08
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		1.99	□□□□□ -2.09
TBC1D23-208	ENST00000486274	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	1.93	□□□□□ -2.1
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		1.86	□□□□□ -2.11
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		1.86	□□□□□ -2.11
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.71	□□□□□ -2.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.7	□□□□□ -2.14
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.62	□□□□□ -2.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	1.62	□□□□□ -2.15
TBC1D23-208	ENST00000486274	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.57	□□□□□ -2.16
TBC1D23-208	ENST00000486274	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TBC1D23-208	ENST00000486274	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.02	□□□□□ -2.25

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