RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.91	□□□□□ -1.78
GTPBP1-208	ENST00000475959	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.89	□□□□□ -1.79
GTPBP1-208	ENST00000475959		V9GYY9	64 aa		3.89	□□□□□ -1.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.85	□□□□□ -1.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.84	□□□□□ -1.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.82	□□□□□ -1.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PCP4	P48539	62 aa		3.81	□□□□□ -1.8
GTPBP1-208	ENST00000475959		A6NED7	52 aa		3.8	□□□□□ -1.8
GTPBP1-208	ENST00000475959		K7ERS5	55 aa		3.79	□□□□□ -1.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.76	□□□□□ -1.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT4	P47944	62 aa		3.73	□□□□□ -1.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.72	□□□□□ -1.81
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.71	□□□□□ -1.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		3.66	□□□□□ -1.82
GTPBP1-208	ENST00000475959	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.64	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.63	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	ROMO1	P60602	79 aa		3.62	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.61	□□□□□ -1.83
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.51	□□□□□ -1.85
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.51	□□□□□ -1.85
GTPBP1-208	ENST00000475959	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.49	□□□□□ -1.85
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.45	□□□□□ -1.86
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.44	□□□□□ -1.86
GTPBP1-208	ENST00000475959	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.41	□□□□□ -1.86
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT1A	P04731	61 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.38	□□□□□ -1.87
GTPBP1-208	ENST00000475959	BRK1	Q8WUW1	75 aa		3.34	□□□□□ -1.87
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.28	□□□□□ -1.88
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.28	□□□□□ -1.88
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.23	□□□□□ -1.89
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GTPBP1-208	ENST00000475959	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.1	□□□□□ -1.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.09	□□□□□ -1.91
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	MT3	P25713	68 aa		3.03	□□□□□ -1.92
GTPBP1-208	ENST00000475959	SVIP	Q8NHG7	77 aa		2.99	□□□□□ -1.93
GTPBP1-208	ENST00000475959	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.95	□□□□□ -1.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.93	□□□□□ -1.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRO0628	Q9UI54	55 aa		2.92	□□□□□ -1.94
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.83	□□□□□ -1.96
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.83	□□□□□ -1.96
GTPBP1-208	ENST00000475959	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		2.8	□□□□□ -1.96
GTPBP1-208	ENST00000475959	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.79	□□□□□ -1.96
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.76	□□□□□ -1.97
GTPBP1-208	ENST00000475959		H3BS24	57 aa		2.72	□□□□□ -1.97
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.68	□□□□□ -1.98
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.64	□□□□□ -1.99
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.58	□□□□□ -2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.55	□□□□□ -2
GTPBP1-208	ENST00000475959	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.44	□□□□□ -2.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.41	□□□□□ -2.02
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.4	□□□□□ -2.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.37	□□□□□ -2.03
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.35	□□□□□ -2.03
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0A0MQY5	61 aa		2.3	□□□□□ -2.04
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.22	□□□□□ -2.05
GTPBP1-208	ENST00000475959	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.21	□□□□□ -2.06
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.08	□□□□□ -2.08
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.05	□□□□□ -2.08
GTPBP1-208	ENST00000475959	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.03	□□□□□ -2.08
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRM1	P04553	51 aa		1.9	□□□□□ -2.11
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.81	□□□□□ -2.12
GTPBP1-208	ENST00000475959	INE1	O15225	51 aa		1.59	□□□□□ -2.15
GTPBP1-208	ENST00000475959	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.47	□□□□□ -2.17
GTPBP1-208	ENST00000475959	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.28	□□□□□ -2.2

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