RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473034.5

RNF25-204, Transcript of ring finger protein 25, human

TSL 2

Gene RNF25, Length 1,807 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNF25-204	ENST00000473034	MT1E	P04732	61 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RNF25-204	ENST00000473034	MT1L	Q93083	61 aa		5.17	□□□□□ -1.58
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
RNF25-204	ENST00000473034	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.13	□□□□□ -1.59
RNF25-204	ENST00000473034	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
RNF25-204	ENST00000473034	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
RNF25-204	ENST00000473034	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RNF25-204	ENST00000473034	MT1G	P13640	62 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF25-204	ENST00000473034	MT1M	Q8N339	61 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RNF25-204	ENST00000473034	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.72	□□□□□ -1.65
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RNF25-204	ENST00000473034	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.68	□□□□□ -1.66
RNF25-204	ENST00000473034	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		4.65	□□□□□ -1.67
RNF25-204	ENST00000473034	NEB	P20929	6669 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF25-204	ENST00000473034	SPRR2E	P22531	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF25-204	ENST00000473034	SPRR2B	P35325	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF25-204	ENST00000473034	SPRR2A	P35326	72 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RNF25-204	ENST00000473034	MDN1	Q9NU22	5596 aa		4.49	□□□□□ -1.69
RNF25-204	ENST00000473034	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.44	□□□□□ -1.7
RNF25-204	ENST00000473034	MT1A	P04731	61 aa		4.39	□□□□□ -1.71
RNF25-204	ENST00000473034	SPRR2D	P22532	72 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF25-204	ENST00000473034	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.37	□□□□□ -1.71
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RNF25-204	ENST00000473034	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.32	□□□□□ -1.72
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RNF25-204	ENST00000473034	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
RNF25-204	ENST00000473034	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RNF25-204	ENST00000473034	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.14	□□□□□ -1.75
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RNF25-204	ENST00000473034	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.07	□□□□□ -1.76
RNF25-204	ENST00000473034	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RNF25-204	ENST00000473034	PRM1	P04553	51 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RNF25-204	ENST00000473034	MT3	P25713	68 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RNF25-204	ENST00000473034	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RNF25-204	ENST00000473034	MT4	P47944	62 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RNF25-204	ENST00000473034	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.7	□□□□□ -1.82
RNF25-204	ENST00000473034	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.69	□□□□□ -1.82
RNF25-204	ENST00000473034	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.67	□□□□□ -1.82
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.59	□□□□□ -1.83
RNF25-204	ENST00000473034	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.57	□□□□□ -1.84
RNF25-204	ENST00000473034	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.49	□□□□□ -1.85
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.46	□□□□□ -1.86
RNF25-204	ENST00000473034	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.28	□□□□□ -1.89
RNF25-204	ENST00000473034	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.11	□□□□□ -1.91
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.1	□□□□□ -1.91
RNF25-204	ENST00000473034	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RNF25-204	ENST00000473034	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RNF25-204	ENST00000473034	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.54	□□□□□ -2
RNF25-204	ENST00000473034	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.49	□□□□□ -2.01
RNF25-204	ENST00000473034	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.26	□□□□□ -2.05
RNF25-204	ENST00000473034	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.25	□□□□□ -2.05
RNF25-204	ENST00000473034	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.56	□□□□□ -2.16

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