RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	MT1G	P13640	62 aa		6.25	□□□□□ -1.41
GCFC2-208	ENST00000472230	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BS24	57 aa		6.2	□□□□□ -1.42
GCFC2-208	ENST00000472230	MT1M	Q8N339	61 aa		6.19	□□□□□ -1.42
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		6.15	□□□□□ -1.42
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		6.14	□□□□□ -1.43
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		6.13	□□□□□ -1.43
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.12	□□□□□ -1.43
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.1	□□□□□ -1.43
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
GCFC2-208	ENST00000472230	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		6	□□□□□ -1.45
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRR2E	P22531	72 aa		5.99	□□□□□ -1.45
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRR2B	P35325	72 aa		5.99	□□□□□ -1.45
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRR2A	P35326	72 aa		5.99	□□□□□ -1.45
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.97	□□□□□ -1.45
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0A0MQY5	61 aa		5.94	□□□□□ -1.46
GCFC2-208	ENST00000472230	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.93	□□□□□ -1.46
GCFC2-208	ENST00000472230	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.77	□□□□□ -1.49
GCFC2-208	ENST00000472230	SPRR2D	P22532	72 aa		5.76	□□□□□ -1.49
GCFC2-208	ENST00000472230	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.66	□□□□□ -1.5
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.65	□□□□□ -1.5
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	5.52	□□□□□ -1.53
GCFC2-208	ENST00000472230	MT1A	P04731	61 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.5	□□□□□ -1.53
GCFC2-208	ENST00000472230	INE1	O15225	51 aa		5.49	□□□□□ -1.53
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.46	□□□□□ -1.53
GCFC2-208	ENST00000472230	NEB	P20929	6669 aa		5.38	□□□□□ -1.55
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.22	□□□□□ -1.57
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GCFC2-208	ENST00000472230	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5.14	□□□□□ -1.59
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		5.11	□□□□□ -1.59
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.1	□□□□□ -1.59
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE4A	Q5TA78	99 aa		5.08	□□□□□ -1.6
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.06	□□□□□ -1.6
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.01	□□□□□ -1.61
GCFC2-208	ENST00000472230	MT4	P47944	62 aa		5	□□□□□ -1.61
GCFC2-208	ENST00000472230	MT3	P25713	68 aa		5	□□□□□ -1.61
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.86	□□□□□ -1.63
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.72	□□□□□ -1.65
GCFC2-208	ENST00000472230	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GCFC2-208	ENST00000472230	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.48	□□□□□ -1.69
GCFC2-208	ENST00000472230	PRM1	P04553	51 aa		4.33	□□□□□ -1.72
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.25	□□□□□ -1.73
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.16	□□□□□ -1.74
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.07	□□□□□ -1.76
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GCFC2-208	ENST00000472230	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.01	□□□□□ -1.77
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4	□□□□□ -1.77
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.98	□□□□□ -1.77
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.97	□□□□□ -1.77
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.96	□□□□□ -1.78
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.95	□□□□□ -1.78
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.94	□□□□□ -1.78
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.88	□□□□□ -1.79
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.7	□□□□□ -1.82
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.7	□□□□□ -1.82
GCFC2-208	ENST00000472230	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.55	□□□□□ -1.84
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.48	□□□□□ -1.85
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.2	□□□□□ -1.9
GCFC2-208	ENST00000472230	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.08	□□□□□ -1.92
GCFC2-208	ENST00000472230	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.98	□□□□□ -1.93
GCFC2-208	ENST00000472230	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.9	□□□□□ -1.94
GCFC2-208	ENST00000472230	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.64	□□□□□ -1.99
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.62	□□□□□ -1.99
GCFC2-208	ENST00000472230	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.96	□□□□□ -2.09

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