RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469521.5

TRAPPC10-208, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC10, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-208ENST00000469521 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP12-3P60328 96 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE4AQ5TA78 99 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 V9GYY9 64 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE1DQ5T752 114 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC10-208ENST00000469521 K7ERS5 55 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC10-208ENST00000469521 Q1T7F1 81 aa6.43□□□□□ -1.38
TRAPPC10-208ENST00000469521 PSPHP1O15172 72 aa6.42□□□□□ -1.38
TRAPPC10-208ENST00000469521 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.39□□□□□ -1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 MT4P47944 62 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.38□□□□□ -1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.35□□□□□ -1.39
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.23□□□□□ -1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 A6NED7 52 aa6.22□□□□□ -1.41
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.2□□□□□ -1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.19□□□□□ -1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TRAPPC10-208ENST00000469521 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.14□□□□□ -1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.11□□□□□ -1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.09□□□□□ -1.43
TRAPPC10-208ENST00000469521 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
TRAPPC10-208ENST00000469521 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.02□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.01□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 ROMO1P60602 79 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE3CQ5T5A8 94 aa6□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP12-4P60329 112 aa5.97□□□□□ -1.45
TRAPPC10-208ENST00000469521 PCP4P48539 62 aa5.95□□□□□ -1.46
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.87□□□□□ -1.47
TRAPPC10-208ENST00000469521 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.78□□□□□ -1.48
TRAPPC10-208ENST00000469521 MT1AP04731 61 aa5.73□□□□□ -1.49
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.65□□□□□ -1.5
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.61□□□□□ -1.51
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.51□□□□□ -1.53
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.48□□□□□ -1.53
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa5.42□□□□□ -1.54
TRAPPC10-208ENST00000469521 BRK1Q8WUW1 75 aa5.32□□□□□ -1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-8O75690 187 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC10-208ENST00000469521 MT3P25713 68 aa5.22□□□□□ -1.57
TRAPPC10-208ENST00000469521 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.12□□□□□ -1.59
TRAPPC10-208ENST00000469521 MUC5ACP98088 5654 aa5.05□□□□□ -1.6
TRAPPC10-208ENST00000469521 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC10-208ENST00000469521 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5□□□□□ -1.61
TRAPPC10-208ENST00000469521 PMAIP1Q13794 54 aa4.99□□□□□ -1.61
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE1EQ5T753 118 aa4.82□□□□□ -1.64
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRAC1Q96KF2 57 aa4.81□□□□□ -1.64
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRO0628Q9UI54 55 aa4.6□□□□□ -1.67
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.53□□□□□ -1.68
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.49□□□□□ -1.69
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE1CQ5T751 118 aa4.47□□□□□ -1.69
TRAPPC10-208ENST00000469521 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.43□□□□□ -1.7
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.32□□□□□ -1.72
TRAPPC10-208ENST00000469521 SVIPQ8NHG7 77 aa4.25□□□□□ -1.73
TRAPPC10-208ENST00000469521 LUZP6Q538Z0 58 aa4.1□□□□□ -1.75
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.07□□□□□ -1.76
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.06□□□□□ -1.76
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.05□□□□□ -1.76
TRAPPC10-208ENST00000469521 LCE1FQ5T754 118 aa3.94□□□□□ -1.78
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.74□□□□□ -1.81
TRAPPC10-208ENST00000469521 H3BS24 57 aa3.71□□□□□ -1.82
TRAPPC10-208ENST00000469521 PHGR1C9JFL3 82 aa3.5□□□□□ -1.85
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.38□□□□□ -1.87
TRAPPC10-208ENST00000469521 NDUFAF8A1L188 74 aa3.2□□□□□ -1.9
TRAPPC10-208ENST00000469521 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.15□□□□□ -1.91
TRAPPC10-208ENST00000469521 PRM1P04553 51 aa3.06□□□□□ -1.92
TRAPPC10-208ENST00000469521 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.66□□□□□ -1.98
TRAPPC10-208ENST00000469521 INE1O15225 51 aa2.59□□□□□ -1.99
TRAPPC10-208ENST00000469521 A0A0A0MQY5 61 aa2.53□□□□□ -2
TRAPPC10-208ENST00000469521 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.28□□□□□ -2.04
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