RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 MP68P56378 58 aa4.05□□□□□ -1.76
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C9orf3-211ENST00000463372 OCR1Q9BZK8 76 aa3.98□□□□□ -1.77
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C9orf3-211ENST00000463372 PRAC1Q96KF2 57 aa3.96□□□□□ -1.78
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C9orf3-211ENST00000463372 K7ERS5 55 aa3.39□□□□□ -1.87
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C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.19□□□□□ -1.9
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C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
C9orf3-211ENST00000463372 ROMO1P60602 79 aa3.13□□□□□ -1.91
C9orf3-211ENST00000463372 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.11□□□□□ -1.91
C9orf3-211ENST00000463372 Q1T7F1 81 aa2.93□□□□□ -1.94
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C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.68□□□□□ -1.98
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.61□□□□□ -1.99
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.57□□□□□ -2
C9orf3-211ENST00000463372 INE1O15225 51 aa2.56□□□□□ -2
C9orf3-211ENST00000463372 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.27□□□□□ -2.05
C9orf3-211ENST00000463372 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.25□□□□□ -2.05
C9orf3-211ENST00000463372 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.88□□□□□ -2.11
C9orf3-211ENST00000463372 PRM1P04553 51 aa1.45□□□□□ -2.18
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