RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.88	□□□□□ -1.79
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.84	□□□□□ -1.79
TTLL3-222	ENST00000459758	MT1M	Q8N339	61 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTLL3-222	ENST00000459758	KMT2D	O14686	5537 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	3.74	□□□□□ -1.81
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTLL3-222	ENST00000459758	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	3.68	□□□□□ -1.82
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL3-222	ENST00000459758	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TTLL3-222	ENST00000459758	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TTLL3-222	ENST00000459758	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR2E	P22531	72 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR2B	P35325	72 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR2A	P35326	72 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TTLL3-222	ENST00000459758	MT1A	P04731	61 aa		3.48	□□□□□ -1.85
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.46	□□□□□ -1.86
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		3.45	□□□□□ -1.86
TTLL3-222	ENST00000459758	SPRR2D	P22532	72 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.35	□□□□□ -1.87
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTLL3-222	ENST00000459758	NEB	P20929	6669 aa		3.34	□□□□□ -1.88
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.32	□□□□□ -1.88
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.27	□□□□□ -1.89
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.25	□□□□□ -1.89
TTLL3-222	ENST00000459758	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		3.22	□□□□□ -1.89
TTLL3-222	ENST00000459758	MT3	P25713	68 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TTLL3-222	ENST00000459758	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.09	□□□□□ -1.91
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.08	□□□□□ -1.92
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3	□□□□□ -1.93
TTLL3-222	ENST00000459758	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.98	□□□□□ -1.93
TTLL3-222	ENST00000459758	PRM1	P04553	51 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.88	□□□□□ -1.95
TTLL3-222	ENST00000459758	MT4	P47944	62 aa		2.85	□□□□□ -1.95
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		2.84	□□□□□ -1.96
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.82	□□□□□ -1.96
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		2.81	□□□□□ -1.96
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE1D	Q5T752	114 aa		2.75	□□□□□ -1.97
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.71	□□□□□ -1.98
TTLL3-222	ENST00000459758	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		2.65	□□□□□ -1.99
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.64	□□□□□ -1.99
TTLL3-222	ENST00000459758	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.6	□□□□□ -1.99
TTLL3-222	ENST00000459758	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.58	□□□□□ -2
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.56	□□□□□ -2
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TTLL3-222	ENST00000459758	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.49	□□□□□ -2.01
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.42	□□□□□ -2.02
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.39	□□□□□ -2.03
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.39	□□□□□ -2.03
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.38	□□□□□ -2.03
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.38	□□□□□ -2.03
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.38	□□□□□ -2.03
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.19	□□□□□ -2.06
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.17	□□□□□ -2.06
TTLL3-222	ENST00000459758	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.16	□□□□□ -2.06
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.15	□□□□□ -2.07
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.85	□□□□□ -2.11
TTLL3-222	ENST00000459758	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.83	□□□□□ -2.12
TTLL3-222	ENST00000459758	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.83	□□□□□ -2.12
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.49	□□□□□ -2.17
TTLL3-222	ENST00000459758	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.2	□□□□□ -2.22

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms