RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 TNP1P09430 55 aa3.02□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 MT1LQ93083 61 aa3.02□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.02□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE3AQ5TA76 89 aa3.01□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.01□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 H7BZZ5 65 aa2.99□□□□□ -1.93
SH3BP1-204ENST00000459646 PRR15LQ9BU68 103 aa2.94□□□□□ -1.94
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1-204ENST00000459646 ANAPC13Q9BS18 74 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.91□□□□□ -1.94
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP12-3P60328 96 aa2.89□□□□□ -1.95
SH3BP1-204ENST00000459646 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.87□□□□□ -1.95
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC179H3BU77 68 aa2.84□□□□□ -1.95
SH3BP1-204ENST00000459646 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.82□□□□□ -1.96
SH3BP1-204ENST00000459646 UQCR11O14957 56 aa2.81□□□□□ -1.96
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.81□□□□□ -1.96
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP12-4P60329 112 aa2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.79□□□□□ -1.96
SH3BP1-204ENST00000459646 K7ERS5 55 aa2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.76□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.75□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.74□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM258P61165 79 aa2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.69□□□□□ -1.98
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC5ACP98088 5654 aa2.68□□□□□ -1.98
SH3BP1-204ENST00000459646 PSPHP1O15172 72 aa2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.66□□□□□ -1.98
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.65□□□□□ -1.99
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
SH3BP1-204ENST00000459646 V9GYY9 64 aa2.61□□□□□ -1.99
SH3BP1-204ENST00000459646 A6NED7 52 aa2.57□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 MT1AP04731 61 aa2.57□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.57□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 SVIPQ8NHG7 77 aa2.57□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.56□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 Q1T7F1 81 aa2.55□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-8O75690 187 aa2.54□□□□□ -2
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.52□□□□□ -2.01
SH3BP1-204ENST00000459646 ROMO1P60602 79 aa2.51□□□□□ -2.01
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.5□□□□□ -2.01
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1-204ENST00000459646 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.47□□□□□ -2.01
SH3BP1-204ENST00000459646 PCP4P48539 62 aa2.45□□□□□ -2.02
SH3BP1-204ENST00000459646 MT3P25713 68 aa2.38□□□□□ -2.03
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0A0MQY5 61 aa2.31□□□□□ -2.04
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.29□□□□□ -2.04
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE1EQ5T753 118 aa2.16□□□□□ -2.06
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.15□□□□□ -2.07
SH3BP1-204ENST00000459646 BRK1Q8WUW1 75 aa2.07□□□□□ -2.08
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE1CQ5T751 118 aa2□□□□□ -2.09
SH3BP1-204ENST00000459646 PMAIP1Q13794 54 aa1.94□□□□□ -2.1
SH3BP1-204ENST00000459646 NDUFAF8A1L188 74 aa1.93□□□□□ -2.1
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.91□□□□□ -2.1
SH3BP1-204ENST00000459646 PRAC1Q96KF2 57 aa1.9□□□□□ -2.11
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE1FQ5T754 118 aa1.84□□□□□ -2.11
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.83□□□□□ -2.12
SH3BP1-204ENST00000459646 PHGR1C9JFL3 82 aa1.79□□□□□ -2.12
SH3BP1-204ENST00000459646 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.67□□□□□ -2.14
SH3BP1-204ENST00000459646 LUZP6Q538Z0 58 aa1.65□□□□□ -2.15
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.63□□□□□ -2.15
SH3BP1-204ENST00000459646 PRO0628Q9UI54 55 aa1.61□□□□□ -2.15
SH3BP1-204ENST00000459646 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.58□□□□□ -2.16
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.55□□□□□ -2.16
SH3BP1-204ENST00000459646 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.36□□□□□ -2.19
SH3BP1-204ENST00000459646 PRM1P04553 51 aa1.29□□□□□ -2.2
SH3BP1-204ENST00000459646 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.08□□□□□ -2.24
SH3BP1-204ENST00000459646 INE1O15225 51 aa0.87□□□□□ -2.27
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