RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444623.5

CSAD-208, Transcript of cysteine sulfinic acid decarboxylase, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSAD, Length 2,122 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.65	□□□□□ -1.51
CSAD-208	ENST00000444623	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		5.64	□□□□□ -1.51
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.57	□□□□□ -1.52
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CSAD-208	ENST00000444623	MT1M	Q8N339	61 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	MT1G	P13640	62 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	INE1	O15225	51 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CSAD-208	ENST00000444623	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.33	□□□□□ -1.56
CSAD-208	ENST00000444623	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.3	□□□□□ -1.56
CSAD-208	ENST00000444623	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	5.28	□□□□□ -1.56
CSAD-208	ENST00000444623	MDN1	Q9NU22	5596 aa		5.25	□□□□□ -1.57
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.12	□□□□□ -1.59
CSAD-208	ENST00000444623	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.09	□□□□□ -1.59
CSAD-208	ENST00000444623	SPRR2E	P22531	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSAD-208	ENST00000444623	SPRR2B	P35325	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSAD-208	ENST00000444623	SPRR2A	P35326	72 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CSAD-208	ENST00000444623	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CSAD-208	ENST00000444623	MT1A	P04731	61 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CSAD-208	ENST00000444623	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CSAD-208	ENST00000444623	NEB	P20929	6669 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CSAD-208	ENST00000444623	SPRR2D	P22532	72 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CSAD-208	ENST00000444623	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CSAD-208	ENST00000444623	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CSAD-208	ENST00000444623	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.38	□□□□□ -1.71
CSAD-208	ENST00000444623	MT3	P25713	68 aa		4.36	□□□□□ -1.71
CSAD-208	ENST00000444623	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		4.32	□□□□□ -1.72
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.25	□□□□□ -1.73
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.24	□□□□□ -1.73
CSAD-208	ENST00000444623	MT4	P47944	62 aa		4.22	□□□□□ -1.73
CSAD-208	ENST00000444623	PRM1	P04553	51 aa		4.16	□□□□□ -1.74
CSAD-208	ENST00000444623	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.15	□□□□□ -1.75
CSAD-208	ENST00000444623	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.13	□□□□□ -1.75
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.12	□□□□□ -1.75
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		4.06	□□□□□ -1.76
CSAD-208	ENST00000444623	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.03	□□□□□ -1.76
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.94	□□□□□ -1.78
CSAD-208	ENST00000444623	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.83	□□□□□ -1.8
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.81	□□□□□ -1.8
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.8	□□□□□ -1.8
CSAD-208	ENST00000444623	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.71	□□□□□ -1.82
CSAD-208	ENST00000444623	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.63	□□□□□ -1.83
CSAD-208	ENST00000444623	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
CSAD-208	ENST00000444623	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.48	□□□□□ -1.85
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.46	□□□□□ -1.86
CSAD-208	ENST00000444623	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
CSAD-208	ENST00000444623	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.43	□□□□□ -1.86
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.32	□□□□□ -1.88
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.18	□□□□□ -1.9
CSAD-208	ENST00000444623	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.14	□□□□□ -1.91
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.1	□□□□□ -1.91
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.97	□□□□□ -1.93
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.91	□□□□□ -1.94
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.86	□□□□□ -1.95
CSAD-208	ENST00000444623	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.64	□□□□□ -1.99
CSAD-208	ENST00000444623	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.57	□□□□□ -2
CSAD-208	ENST00000444623	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.57	□□□□□ -2
CSAD-208	ENST00000444623	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.69	□□□□□ -2.14

Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 1328.9 ms